More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8441 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  100 
 
 		 422 aa  819    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 502 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  53.12 
 
 		 345 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 374 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  45.1 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.82 
 
 		 475 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.64 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  45.05 
 
 		 331 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 463 aa  99.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  47.71 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  35.27 
 
 		 458 aa  96.7  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.81 
 
 		 438 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.54 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  27.54 
 
 		 350 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  40 
 
 		 491 aa  93.2  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 306 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 453 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  39.82 
 
 		 337 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 625 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  27.87 
 
 		 371 aa  91.3  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  39.09 
 
 		 452 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  39.45 
 
 		 398 aa  89.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  39.32 
 
 		 315 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  43.81 
 
 		 487 aa  88.6  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  38.94 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  34.23 
 
 		 432 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.55 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  36.44 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  36.07 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  37.19 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  46.07 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.86 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  29.28 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  41.24 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  33.7 
 
 		 501 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  42.48 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  27.88 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  36.07 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  39.09 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  41.84 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  26.94 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  41.28 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  39.8 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  34.31 
 
 		 531 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  37.39 
 
 		 323 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  35.71 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  35.11 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  40.66 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  36.79 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  40.5 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.54 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.05 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  40.62 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  32.22 
 
 		 517 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  34.68 
 
 		 368 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  21.27 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  21.03 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  34.44 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  35.67 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  36.22 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  34.35 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  39.53 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  39.58 
 
 		 524 aa  73.9  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  32.83 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  37.78 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.62 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  33.85 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  32.09 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  40.86 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.61 
 
 		 210 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  33.85 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  32.09 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  32.09 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  37.63 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.27 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  38.38 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  30.34 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  39.18 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.24 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  26.19 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  30.56 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  40 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  39.6 
 
 		 180 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 182 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  38.61 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  34.69 
 
 		 162 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>