More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32150 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  100 
 
 		 475 aa  927    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  42.37 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  63.57 
 
 		 502 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  54.26 
 
 		 463 aa  154  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.2 
 
 		 329 aa  127  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  54.17 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  42.4 
 
 		 331 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  41.03 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  40.17 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  41.09 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.61 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  47 
 
 		 222 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  51.85 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 458 aa  100  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  42.15 
 
 		 306 aa  100  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  40 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 345 aa  99.4  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  38.81 
 
 		 625 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  44.68 
 
 		 232 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 447 aa  98.2  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 452 aa  96.7  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  39.06 
 
 		 340 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.16 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  43.3 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.75 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  41.8 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  38.03 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.59 
 
 		 176 aa  94.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  46.94 
 
 		 180 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 337 aa  94  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  44.32 
 
 		 350 aa  94.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  43.88 
 
 		 349 aa  93.6  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 347 aa  93.6  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  42.42 
 
 		 366 aa  93.2  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  43.59 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  45.37 
 
 		 327 aa  93.2  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  43.59 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 476 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  35.77 
 
 		 257 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  45.54 
 
 		 317 aa  92  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  31.95 
 
 		 307 aa  92.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  41.28 
 
 		 162 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  45.63 
 
 		 323 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 236 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 334 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.59 
 
 		 332 aa  90.9  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.38 
 
 		 235 aa  90.5  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  48.42 
 
 		 390 aa  90.5  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.84 
 
 		 321 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 501 aa  90.1  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  47.13 
 
 		 373 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 392 aa  90.1  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 342 aa  90.1  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 340 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 319 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 366 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  40.65 
 
 		 302 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 231 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  38.6 
 
 		 392 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  40.59 
 
 		 333 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 199 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 293 aa  87.8  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  40.5 
 
 		 190 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  36.59 
 
 		 368 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  34.43 
 
 		 265 aa  87  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  37.74 
 
 		 391 aa  87  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  44.32 
 
 		 335 aa  87  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 204 aa  87  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 323 aa  86.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  38.39 
 
 		 517 aa  86.7  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  43 
 
 		 298 aa  86.7  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  40.4 
 
 		 367 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44 
 
 		 210 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  51.72 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 164 aa  85.9  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  40.17 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  36.56 
 
 		 173 aa  84.7  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  37.21 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  36.69 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  40.71 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  40.74 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.21 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.39 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  40.4 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  42.57 
 
 		 273 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  35.19 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  39.6 
 
 		 375 aa  83.2  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  40.38 
 
 		 1048 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 286 aa  83.2  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>