More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3958 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  100 
 
 		 323 aa  638    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  80.5 
 
 		 323 aa  519  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  35.97 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  32.25 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  32.38 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  30.62 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  36.33 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  30.63 
 
 		 330 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  31.25 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  31.49 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  32.41 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  30.9 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  29.74 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  34.19 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  32.13 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  29.39 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  26.63 
 
 		 350 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  31.75 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  42.37 
 
 		 453 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  35.96 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  29.77 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  27.42 
 
 		 348 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  28.81 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  30.29 
 
 		 394 aa  95.9  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  28.42 
 
 		 366 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  45.19 
 
 		 432 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  50 
 
 		 459 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  45.19 
 
 		 432 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  26.87 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  47.31 
 
 		 236 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  47.96 
 
 		 417 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  42.72 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 162 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  23.45 
 
 		 391 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 463 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  43.56 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  43.27 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  46.23 
 
 		 235 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  40.18 
 
 		 398 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  28.46 
 
 		 347 aa  86.3  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  36.81 
 
 		 388 aa  85.9  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.84 
 
 		 222 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  46.51 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  39.52 
 
 		 202 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.11 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  46.88 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  44.71 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 502 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 204 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.19 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  31.08 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 116 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  30.9 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  42.16 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  42.16 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  35.46 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  44 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  34.65 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.3 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  41.24 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  42.16 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  28.11 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  37.14 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  40.78 
 
 		 625 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  38.24 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  34.13 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  42 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  45.26 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  46.49 
 
 		 190 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  39.64 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  36.36 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  40.59 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  28.03 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  40.38 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  40 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  35.38 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  36.75 
 
 		 432 aa  75.9  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  41.75 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4888  cell wall endopeptidase  36.09 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  46.6 
 
 		 199 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  31.82 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  43.02 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  38.39 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 177 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4873  cell wall endopeptidase  36.09 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  35.16 
 
 		 1048 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  32.89 
 
 		 556 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  25.51 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  25.51 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>