More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6205 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  100 
 
 		 417 aa  814    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  60.72 
 
 		 459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.99 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  34.53 
 
 		 342 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  35.54 
 
 		 340 aa  176  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  34.27 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  41.15 
 
 		 337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  32.66 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  56.78 
 
 		 331 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  35.49 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  30.26 
 
 		 319 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  52.78 
 
 		 531 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  52.29 
 
 		 332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  50.43 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  54.13 
 
 		 345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  40 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  29.97 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  33.9 
 
 		 375 aa  123  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  49.12 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  48.67 
 
 		 452 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  31.55 
 
 		 388 aa  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  28.85 
 
 		 333 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  45.87 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  31.71 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  51.28 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  46.61 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  50.88 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  47.9 
 
 		 501 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 453 aa  116  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  49.5 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  48.18 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  47.75 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  49.14 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.36 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  52.59 
 
 		 236 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  43.06 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  28.7 
 
 		 366 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  45.9 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  45.83 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  27.18 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  49.51 
 
 		 235 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 308 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  46.96 
 
 		 347 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.67 
 
 		 393 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 517 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  28.28 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  30.96 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  44.63 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  42.76 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.79 
 
 		 176 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  47.71 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.06 
 
 		 475 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  31.56 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 347 aa  106  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  32.25 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  46.55 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  37.08 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  43.65 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 363 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  42.48 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  45.1 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  47.01 
 
 		 160 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  43.18 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  28.7 
 
 		 330 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  33.68 
 
 		 625 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  46.83 
 
 		 308 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  47.27 
 
 		 370 aa  101  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  43.85 
 
 		 230 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  41.59 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 370 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  41.59 
 
 		 348 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 301 aa  99.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  31.21 
 
 		 373 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  40.36 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  46.79 
 
 		 327 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 317 aa  99.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  39.87 
 
 		 273 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  47.96 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  36.98 
 
 		 323 aa  99  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  46.23 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 502 aa  98.2  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  43.14 
 
 		 286 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  38.81 
 
 		 479 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  36.57 
 
 		 478 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 447 aa  96.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 556 aa  96.7  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  44.03 
 
 		 175 aa  96.3  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.25 
 
 		 210 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  39.68 
 
 		 475 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  47.57 
 
 		 197 aa  95.9  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  44.12 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  39.68 
 
 		 475 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>