More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4520 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  100 
 
 
472 aa  942    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  63.21 
 
 
467 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  63.21 
 
 
467 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  64.35 
 
 
469 aa  560  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  61.34 
 
 
469 aa  551  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  61.34 
 
 
469 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  61.76 
 
 
469 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  64.97 
 
 
467 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  62.05 
 
 
469 aa  551  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  59.62 
 
 
475 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  59.62 
 
 
475 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  59.62 
 
 
475 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  55.81 
 
 
478 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  58.65 
 
 
479 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  59.58 
 
 
472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  46 
 
 
432 aa  342  7e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  61.61 
 
 
225 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  57.21 
 
 
248 aa  257  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  57.41 
 
 
256 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  59.9 
 
 
256 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  59.9 
 
 
256 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  57.41 
 
 
257 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  56.48 
 
 
256 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  57.41 
 
 
257 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  57.41 
 
 
257 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  56.48 
 
 
256 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  55.56 
 
 
248 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  57.41 
 
 
256 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  54.84 
 
 
221 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  55.19 
 
 
241 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  55.19 
 
 
241 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  54.33 
 
 
239 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  55.05 
 
 
253 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  51.69 
 
 
230 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  52.48 
 
 
228 aa  223  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  60.24 
 
 
164 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  60.42 
 
 
505 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  33.81 
 
 
498 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  58.65 
 
 
427 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  54.2 
 
 
249 aa  154  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  48.2 
 
 
388 aa  150  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3253  NLP/P60 protein  41.48 
 
 
214 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2702  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
204 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2672  NLP/P60  42.29 
 
 
204 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0993565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2717  NLP/P60 protein  42.29 
 
 
204 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0128692  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2970  NLP/P60 protein  39.89 
 
 
208 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  43.09 
 
 
388 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  45.37 
 
 
340 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
625 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  41.59 
 
 
394 aa  104  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  36.42 
 
 
388 aa  104  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
458 aa  103  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.22 
 
 
337 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.48 
 
 
531 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  46.49 
 
 
308 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  45.22 
 
 
447 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  42.11 
 
 
337 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
345 aa  94.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  40.54 
 
 
417 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  38.76 
 
 
350 aa  92.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  50.43 
 
 
411 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.91 
 
 
321 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.61 
 
 
438 aa  90.5  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  35.26 
 
 
370 aa  90.1  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  42.73 
 
 
342 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  42.74 
 
 
302 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  40.34 
 
 
378 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  38.28 
 
 
273 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  34.62 
 
 
1048 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  39.81 
 
 
337 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  41.6 
 
 
463 aa  88.6  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  38.52 
 
 
502 aa  88.2  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  38.94 
 
 
372 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  38.94 
 
 
372 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  36.89 
 
 
452 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  38.94 
 
 
372 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  41.07 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  39.62 
 
 
180 aa  87  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  40.98 
 
 
491 aa  85.1  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
199 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  35.96 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.83 
 
 
378 aa  84  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  31.29 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  36.6 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.72 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  30.99 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  34.48 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  43.48 
 
 
190 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  37.68 
 
 
546 aa  82.4  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  39.67 
 
 
487 aa  81.6  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  43.14 
 
 
375 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  33.61 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  39.09 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  33.61 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  37.84 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  33.61 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  42.31 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  35.34 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  35.25 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>