More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3592 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  100 
 
 
345 aa  698    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  29.72 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  30.61 
 
 
385 aa  105  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  30.52 
 
 
309 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  31.8 
 
 
281 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  26.19 
 
 
335 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  28.83 
 
 
303 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  24.8 
 
 
333 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  31.6 
 
 
281 aa  99.8  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  27.97 
 
 
292 aa  99.8  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  27.31 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  28.78 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  31.92 
 
 
288 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  31.1 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  28.02 
 
 
253 aa  96.7  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  23.2 
 
 
333 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  35.23 
 
 
270 aa  96.3  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  30.04 
 
 
283 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  32 
 
 
245 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  23.2 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  27.06 
 
 
259 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  23.4 
 
 
424 aa  93.2  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  23.2 
 
 
333 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  23.2 
 
 
333 aa  92.4  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  23.2 
 
 
333 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  23.2 
 
 
333 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  30.2 
 
 
281 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  29.32 
 
 
250 aa  91.3  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  23.2 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  30.04 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  31.25 
 
 
271 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  23.2 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  23.2 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  22.8 
 
 
333 aa  89.7  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  31.25 
 
 
270 aa  89.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  28.67 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  29.17 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  30.15 
 
 
278 aa  87.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  27.24 
 
 
263 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  26.35 
 
 
249 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  38.1 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  33.61 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  27.34 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  29.12 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  34.25 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  35.07 
 
 
230 aa  82.4  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  31.06 
 
 
150 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  37.14 
 
 
269 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  32.31 
 
 
178 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  36.19 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  27.51 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  28.7 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2708  NLP/P60 protein  31.35 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  41.23 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  25.76 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  40.54 
 
 
452 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  35.66 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  28.36 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  27.44 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  36.73 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  37.14 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  34.21 
 
 
257 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.12 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  30.77 
 
 
210 aa  78.2  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  34.51 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  28.16 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  29.21 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  28.63 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  32.17 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  38.38 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  26.57 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  34.21 
 
 
205 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  27.07 
 
 
260 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  35.24 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  32.35 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  28.02 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  36.44 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  33.91 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  25.46 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  27.9 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  33.91 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  27.9 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  35 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  35.96 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0870  NLP/P60 protein  33.9 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  28.32 
 
 
276 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  29.89 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  35.61 
 
 
175 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  31.58 
 
 
150 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  37.82 
 
 
1048 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  33.91 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  28.37 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  27.38 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  33.91 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  31.9 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  34.81 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  39.82 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  37.39 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  31.43 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  27.94 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>