254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3951 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  100 
 
 		 286 aa  586  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  59.57 
 
 		 290 aa  335  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  59.57 
 
 		 290 aa  335  3.9999999999999995e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  57.45 
 
 		 286 aa  323  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  55.24 
 
 		 286 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  56.4 
 
 		 288 aa  316  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  54.58 
 
 		 285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  53.17 
 
 		 285 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  47.7 
 
 		 284 aa  272  5.000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  49.29 
 
 		 286 aa  262  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  48.21 
 
 		 286 aa  248  9e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  51.14 
 
 		 294 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  47.86 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  47.08 
 
 		 288 aa  245  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  47.5 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  46.32 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  45.39 
 
 		 289 aa  228  9e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  48.85 
 
 		 294 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  42.7 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  43.11 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  40.21 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  41.64 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  43.82 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  38.79 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  42.31 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  39.5 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  40.67 
 
 		 279 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  43.7 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  37.63 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 270 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  41.54 
 
 		 279 aa  168  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2708  NLP/P60 protein  37.68 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  38.35 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  40.68 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  37.97 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  36.12 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  29.7 
 
 		 385 aa  85.5  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  33.04 
 
 		 245 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  28.9 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  27.51 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  33.05 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  27.47 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  29.49 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  29.15 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  26.56 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  28.63 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  27.54 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  28.15 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  29.12 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  28.26 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  28.26 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  28.38 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  28.26 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  27.83 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  41.67 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  28.4 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  27.95 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.94 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  27.95 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  27.95 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  27.95 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  27.95 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  27.8 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1813  NLP/P60 protein  24.55 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.28 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  40 
 
 		 368 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.45 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  37.11 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  37.74 
 
 		 362 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.04 
 
 		 388 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  45.07 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03920  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  29.91 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  37.14 
 
 		 362 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  37.14 
 
 		 362 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  38.54 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  34.82 
 
 		 188 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.67 
 
 		 556 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  38.24 
 
 		 175 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.49 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  37.74 
 
 		 392 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  37.25 
 
 		 174 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  34.82 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  37.11 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  34.55 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 535 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2073  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  34.83 
 
 		 1048 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4838  NLP/P60 protein  36.19 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.11848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  34.86 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 168 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  33.88 
 
 		 208 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  38.82 
 
 		 524 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  34.53 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  34.43 
 
 		 208 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  35.85 
 
 		 384 aa  50.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  34.41 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  31.96 
 
 		 186 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>