More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1111 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  100 
 
 		 295 aa  579  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  38.73 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  42.75 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  38.83 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  40.07 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  37.96 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  40.75 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  40.22 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  39.57 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  40.38 
 
 		 286 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  38.52 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  38.13 
 
 		 288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  40.56 
 
 		 294 aa  135  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  36.53 
 
 		 281 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  39.59 
 
 		 283 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  41.63 
 
 		 281 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  37.88 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  35.46 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  37.17 
 
 		 303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  35.46 
 
 		 290 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  35.46 
 
 		 290 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  37.89 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  36.69 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  33.33 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  37.69 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  36.12 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  33.21 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  36.68 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  33.22 
 
 		 289 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2708  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  33.58 
 
 		 278 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  27.64 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  37.56 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  37.33 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  37.6 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  37.19 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  38.32 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  30.04 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  32.03 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  27.12 
 
 		 253 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  35.56 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  27.23 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  29.12 
 
 		 337 aa  89.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  41.59 
 
 		 385 aa  89  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  29.53 
 
 		 260 aa  86.3  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  25.57 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  34.15 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  27.43 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  30.95 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  28.03 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  47.37 
 
 		 174 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  28.92 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47.13 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  27.95 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1813  NLP/P60 protein  23.33 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  28.45 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  28.29 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  45.19 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  32.46 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  31.75 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  32.5 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  28.88 
 
 		 333 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  28.02 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  35 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  41.75 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  28.02 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  28.02 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3603  NLP/P60 protein  47.87 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.1 
 
 		 556 aa  65.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.36 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  36.27 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  27.16 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  36 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  39.6 
 
 		 181 aa  65.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  44.05 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  36.27 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  26.77 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  42.71 
 
 		 176 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  27.16 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  35.71 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  42.73 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  37.86 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  35.35 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 524 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  39.6 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  32.14 
 
 		 532 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  27.16 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2073  NLP/P60 protein  37.76 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  41.77 
 
 		 535 aa  63.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  35.35 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  34.53 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  34.45 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>