More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0712 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  100 
 
 		 306 aa  608  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  50 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  44.2 
 
 		 279 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  42.75 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  42.75 
 
 		 286 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  42.25 
 
 		 276 aa  178  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  41.11 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  45.35 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  41.83 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  44.87 
 
 		 294 aa  168  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  40.97 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  38.57 
 
 		 283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  38.75 
 
 		 286 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  38.43 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  39.5 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  38.66 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  38.21 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  39.72 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  36.49 
 
 		 285 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  38.71 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  36.79 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  35.84 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  37.41 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  37.97 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  38.66 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  36.14 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  36.14 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  37.05 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  33.83 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  36.93 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  35.74 
 
 		 270 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  35.1 
 
 		 271 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  35.1 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  38.43 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2708  NLP/P60 protein  35.38 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  37.13 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  32.14 
 
 		 385 aa  92.8  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  27.6 
 
 		 250 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  32.74 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  27.27 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  30.65 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  32.33 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  32.59 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  38.76 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  48.89 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  34.39 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  28.03 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  43.96 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  28.45 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  44.58 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.55 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  42.71 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.15 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  41 
 
 		 174 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  46.25 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  43.53 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  31.18 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  36.29 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  36.29 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.57 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  36.54 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  30.59 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  31.06 
 
 		 345 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.58 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  45.35 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  33.91 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  32.82 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  37 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  37 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  39.6 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  39.6 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  41.11 
 
 		 524 aa  67  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 188 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  23.14 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  42.99 
 
 		 160 aa  67  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  41.44 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  35.05 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.6 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  40 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 388 aa  65.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  41.11 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  43.3 
 
 		 154 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  43.9 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  35.4 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  40 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  38.95 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.5 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.96 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  37.11 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1813  NLP/P60 protein  26.87 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>