More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1813 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1813  NLP/P60 protein  100 
 
 		 258 aa  534  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  46.64 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  45.97 
 
 		 249 aa  226  4e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  39.92 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  35.77 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  35.8 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  44.66 
 
 		 232 aa  86.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  28.62 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  28.76 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  24.72 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  27.59 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  41.44 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  28.17 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0033  NLP/P60 protein  25.23 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  39.05 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  26.25 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  28.29 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  37.74 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  28.12 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.3 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  28.12 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  25.64 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  26.19 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  38.05 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  27.68 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  27.68 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  27.68 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  27.68 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  26.34 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  27.68 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  26.44 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  36.89 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  27.23 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  23.94 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.56 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  26.24 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  27.23 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  37.78 
 
 		 368 aa  72  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  26.56 
 
 		 283 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  29.08 
 
 		 296 aa  72  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  31.36 
 
 		 335 aa  72  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  34.4 
 
 		 1048 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  27.44 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  27.51 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  26.97 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  37.06 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  38.14 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.56 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  24.15 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  26.67 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  38.68 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  34.19 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  26.34 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  38.68 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  25 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  27.97 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  33.33 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  35.45 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  37.96 
 
 		 391 aa  68.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  33.9 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  38 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  40 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  37.62 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  40 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  40.45 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  37.5 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  37.04 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  40.66 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  36.36 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  39.58 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0696  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  30.54 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  39.18 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  30.39 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  33.58 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  34.43 
 
 		 183 aa  67  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  24.38 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  35.92 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  33.86 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  34.55 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  27.1 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  36.89 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  23.32 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  24 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  32.28 
 
 		 181 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  33.9 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  41.84 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  33.08 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  36.19 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  25.24 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  35.45 
 
 		 168 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  35.85 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0399  NlpC/P60 family protein  32.11 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  34.62 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  28.97 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>