More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4311 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  100 
 
 		 286 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  68.29 
 
 		 286 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  66.2 
 
 		 286 aa  364  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  66.9 
 
 		 286 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  69.15 
 
 		 294 aa  345  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  68.09 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  50.87 
 
 		 288 aa  275  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  54.23 
 
 		 279 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  50.7 
 
 		 286 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  51.59 
 
 		 281 aa  259  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  50 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  48.08 
 
 		 290 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  48.08 
 
 		 290 aa  249  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  50.88 
 
 		 303 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  51.76 
 
 		 283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  49.12 
 
 		 289 aa  245  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  47.74 
 
 		 285 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  47.22 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  49.47 
 
 		 281 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  49.12 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  46.83 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  46.76 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  46.32 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 285 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  44.6 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  46.74 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  47.69 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  47.33 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  39.35 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  40.43 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  42.81 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  43.43 
 
 		 246 aa  188  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  41.84 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  41.92 
 
 		 271 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  41.92 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2708  NLP/P60 protein  42.7 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  41.11 
 
 		 306 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  37.81 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  29.11 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  28.67 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  28.27 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  25.87 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  25.11 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  27.35 
 
 		 337 aa  79  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  28.47 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  27.13 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  30.07 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  27.05 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  27.05 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  27.05 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  29.67 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  25.93 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  27.05 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  27.05 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  26.7 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  25.93 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  25.75 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  40.96 
 
 		 524 aa  66.2  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  35 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  23.48 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  26.23 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.54 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  24.26 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.46 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  34.31 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  25.47 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.33 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  24.57 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  29.77 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  29.11 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  32.08 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1813  NLP/P60 protein  25.33 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  42.17 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  38.54 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  38.32 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  40.59 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  40.59 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.29 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_002620  TC0403  Nlp/P60 family protein  25.51 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000865774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  42.27 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  41.75 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  30.56 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  45.57 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  29.2 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  44.12 
 
 		 388 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  35.9 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  36.26 
 
 		 368 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  36.56 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  36.63 
 
 		 349 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  29.27 
 
 		 186 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  30.69 
 
 		 207 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  36.96 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  36.08 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  36.36 
 
 		 388 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 419 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  36.94 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  26.28 
 
 		 346 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19631  hypothetical protein  34.26 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.333076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03920  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.46 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 242 aa  53.1  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>