130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03920 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03920  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  100 
 
 		 297 aa  591  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  42.69 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  43.03 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  42.29 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  42.29 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  42.29 
 
 		 333 aa  202  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  42.69 
 
 		 333 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  42.29 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  42.29 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  41.9 
 
 		 333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  41.9 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  42.29 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03360  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.72 
 
 		 580 aa  183  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 346 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  34.36 
 
 		 314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  34.65 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  30.39 
 
 		 292 aa  92.8  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  28.28 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  28.85 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  29.49 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  31.39 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  29.19 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  25.6 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.9 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  25.96 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  29.02 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  33.58 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  33.88 
 
 		 1048 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  31.11 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  29.73 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  30.99 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  46.27 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  30.05 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  41.43 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  32.09 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  39.47 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  32.09 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2003  NLP/P60 protein  32.56 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000114468  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0721  NLP/P60 family protein  33 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  28.06 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  31.07 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  32 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  38.75 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.18 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  27.34 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  31.75 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  30 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  29.91 
 
 		 286 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  31.46 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  28.64 
 
 		 279 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  32.1 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  27.91 
 
 		 285 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  38.16 
 
 		 385 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  27.01 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  46.03 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  31.58 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  40 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  30.48 
 
 		 178 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  26.01 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  26.01 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  29.11 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  26.29 
 
 		 532 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  38.24 
 
 		 476 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0696  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  36.62 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  27.19 
 
 		 232 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  26.29 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 216 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  32.93 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  37.14 
 
 		 295 aa  49.3  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0033  NLP/P60 protein  24.07 
 
 		 308 aa  49.3  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  32.74 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  40 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  37.14 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.47 
 
 		 388 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  29.73 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  39.06 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1158  NLP/P60 protein  33.75 
 
 		 181 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  35.62 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  35.24 
 
 		 168 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  32.86 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  24.57 
 
 		 532 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  26.05 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  25.79 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  42.55 
 
 		 577 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 536 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  42.55 
 
 		 582 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  31.03 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  42.55 
 
 		 582 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  33.82 
 
 		 342 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  31.94 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  34.88 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  35.82 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  40.43 
 
 		 578 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  40.43 
 
 		 598 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  43.18 
 
 		 582 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.82 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>