More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3233 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  100 
 
 		 279 aa  556  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  48 
 
 		 278 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  47.69 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  48.74 
 
 		 286 aa  214  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  48.38 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  48.38 
 
 		 286 aa  205  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  46.72 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  50.18 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  43.45 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  43.11 
 
 		 289 aa  188  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  49.82 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  42.98 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2708  NLP/P60 protein  40.94 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  42.75 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  44.49 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 281 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  44.12 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  43.07 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  39.78 
 
 		 285 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  41.54 
 
 		 286 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  39.05 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  43.45 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  42.41 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  42.7 
 
 		 281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  39.93 
 
 		 286 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  35.21 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 312 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  42.18 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  42.16 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  39.05 
 
 		 283 aa  158  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  40.29 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  41.49 
 
 		 294 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  40.29 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  39.78 
 
 		 286 aa  151  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  39.07 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  40.28 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  37.5 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  27.9 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  28.17 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 385 aa  79.3  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  40 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  28.37 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  26.32 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  43.96 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  33.49 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.05 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  40 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  25.25 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  40.45 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  31.84 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  43.3 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  44.87 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  38.32 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  35.96 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  37.37 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  45.78 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  38.82 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.76 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 524 aa  62.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  44.3 
 
 		 334 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  35.45 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  46.05 
 
 		 535 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  36.54 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  36.54 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.22 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  36.54 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  36.54 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.05 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.75 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  36.54 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  36.67 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  38.38 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  36.54 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  46.25 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  39.18 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  36 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  43.33 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.86 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  45.24 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.86 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  39.33 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.08 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  34.74 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  36.96 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  28.22 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  44.32 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  41.11 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  34.78 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2656  NLP/P60 protein  34.26 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.939952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  40.23 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 368 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  39.33 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  40.51 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  34.48 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  34.19 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  38.2 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>