More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1657 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  100 
 
 		 186 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.54 
 
 		 265 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  34.07 
 
 		 156 aa  98.2  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  39.47 
 
 		 217 aa  98.2  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  42.97 
 
 		 150 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  41.04 
 
 		 333 aa  96.7  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  34.62 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 240 aa  95.9  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 245 aa  95.1  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  35.82 
 
 		 154 aa  95.1  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  35.46 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  36.76 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 189 aa  93.6  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  44.17 
 
 		 274 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  39.26 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 150 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 164 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 391 aa  92  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 164 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 164 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  35.17 
 
 		 325 aa  92  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 154 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  40.14 
 
 		 476 aa  91.7  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  41.44 
 
 		 154 aa  90.9  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  36.23 
 
 		 391 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 333 aa  89.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  34.18 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  40.34 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  35.07 
 
 		 159 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  35.07 
 
 		 159 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  35.07 
 
 		 159 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  38.81 
 
 		 458 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  40 
 
 		 302 aa  88.6  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  34.81 
 
 		 178 aa  88.2  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  39.82 
 
 		 167 aa  88.2  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  40.5 
 
 		 582 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 246 aa  87.4  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  35.1 
 
 		 191 aa  87.8  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 536 aa  87.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  39.52 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  38.28 
 
 		 424 aa  86.3  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 246 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  37.19 
 
 		 450 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  37.1 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  34.87 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  33.53 
 
 		 216 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  35.54 
 
 		 331 aa  85.9  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.14 
 
 		 303 aa  85.9  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  40.65 
 
 		 1048 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  34.18 
 
 		 337 aa  85.9  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 378 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  39.25 
 
 		 388 aa  85.5  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  30 
 
 		 148 aa  85.5  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  39.09 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  31.35 
 
 		 269 aa  85.1  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.26 
 
 		 388 aa  85.1  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  38.39 
 
 		 147 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  39.09 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  38.39 
 
 		 147 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  37.19 
 
 		 342 aa  84.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  33.12 
 
 		 191 aa  84.7  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  36.89 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2940  NLP/P60 protein  34.09 
 
 		 217 aa  85.1  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.284799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  36.97 
 
 		 266 aa  85.1  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  36.11 
 
 		 342 aa  84.7  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 190 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  33.57 
 
 		 341 aa  84.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 190 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 190 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  38 
 
 		 452 aa  84.7  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 575 aa  84.7  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  41.27 
 
 		 177 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 295 aa  84.3  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.8 
 
 		 327 aa  84.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  36.29 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  36.92 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  37.1 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  45.74 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  33.79 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  41.46 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  30.77 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  38.79 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  29.79 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  31.84 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  36.11 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.77 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  40.65 
 
 		 577 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.68 
 
 		 580 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>