More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3041 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  100 
 
 		 288 aa  583  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  62.11 
 
 		 286 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  55.94 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  53.87 
 
 		 286 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  53.17 
 
 		 286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  50.87 
 
 		 286 aa  275  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  50.35 
 
 		 286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  54.51 
 
 		 279 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  54.2 
 
 		 294 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  48.78 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  48.42 
 
 		 281 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  46.13 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  47.02 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  47.02 
 
 		 281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  47.08 
 
 		 286 aa  245  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  49.3 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  48.42 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  47.72 
 
 		 279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  46.18 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  46.18 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  45.88 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  46.59 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  45.02 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  45.52 
 
 		 285 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  43.06 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  43.82 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  40.56 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  40.49 
 
 		 278 aa  199  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  43.45 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  41.26 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  46.96 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  43.51 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  42.25 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2708  NLP/P60 protein  39.72 
 
 		 282 aa  171  9e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  41.4 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  39.86 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  35.44 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  30.22 
 
 		 385 aa  95.5  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  27.2 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  27.44 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  28.11 
 
 		 249 aa  79  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  32 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  31.67 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  30 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  32.37 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  26.92 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  26.92 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  27.03 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  23.9 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  45.68 
 
 		 388 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  26.07 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  25.85 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  26.07 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  25.94 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  26.07 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  26.07 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  25.85 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  25.41 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.39 
 
 		 556 aa  62.4  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  29.63 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.62 
 
 		 388 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  32.35 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  26.34 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  25 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  25 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.02 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 524 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.29 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  30.19 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  35.96 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  34.68 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03920  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.58 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  33 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  33.65 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  29.8 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0403  Nlp/P60 family protein  29.36 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000865774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  39.77 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  30.83 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  25.35 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  36.04 
 
 		 174 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  41.77 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  36.96 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  36.96 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  30.83 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  31.68 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  32.41 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  28.57 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  33.96 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  38.38 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  34.62 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  27.96 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  35.19 
 
 		 452 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23421  hypothetical protein  38.89 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>