More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0403 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0403  Nlp/P60 family protein  100 
 
 		 281 aa  585  1e-166  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000865774  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  27.34 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  35.78 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  33.64 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  34.21 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  34.51 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  35.4 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  33.63 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  34.51 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  29.58 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  32.11 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  33.91 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  32.81 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  32.11 
 
 		 177 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  31.19 
 
 		 177 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  26.97 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  31.19 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  31.53 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  34.19 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  36.79 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  33.06 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  26.32 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  31.3 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  30.84 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  32.77 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  30.19 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  32.28 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  29.51 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  31.82 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  34.34 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  33.61 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  30.08 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  35.58 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  33.64 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  29.51 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  34.91 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  23.69 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  32.82 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  32.82 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.71 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  32.41 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  31.72 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  31.25 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  34.62 
 
 		 536 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  29.13 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  32.41 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  31.48 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  31.72 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  34.58 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  32.41 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  31.72 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  32.62 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  29.27 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 532 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  30.77 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  23.95 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  30.91 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  38.53 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  31.2 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  22.29 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  28.06 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  29.94 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  26.43 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  28.46 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  32.05 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  34.15 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  33.64 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  29.36 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  30.34 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  31.68 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  30.65 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  33.61 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  30.56 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 150 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  29.83 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  33.86 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  36.89 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  29.83 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  34.41 
 
 		 174 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  36.63 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  29.36 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  34.19 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  29.83 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  29.83 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  29.83 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  29.83 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  33.04 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  29.83 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  34.91 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  25.51 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  32.76 
 
 		 154 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  36.89 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  32.35 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>