More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3759 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  100 
 
 
314 aa  630  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  34.15 
 
 
333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  33.8 
 
 
333 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  32.89 
 
 
333 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  33.45 
 
 
333 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  34.75 
 
 
335 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  33.45 
 
 
333 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  33.45 
 
 
333 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  33.1 
 
 
333 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  33.1 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  33.1 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  33.1 
 
 
333 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  33.1 
 
 
333 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  32.64 
 
 
346 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03920  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.36 
 
 
297 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03360  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.01 
 
 
580 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  31.36 
 
 
337 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  36.15 
 
 
309 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  31.4 
 
 
245 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  29.75 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  48.45 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  41.82 
 
 
385 aa  82.4  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  28.4 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  29.35 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  29.97 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  37.34 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  34.15 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  45.71 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  29.82 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  29.5 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  47.42 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  29.5 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
211 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  30.9 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  48.78 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  40.94 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  40.94 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  41.28 
 
 
176 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  30 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  28.09 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0303  NLP/P60 protein  50.59 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
168 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  48.53 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  28.33 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  42.45 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  31.44 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  45 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  41.77 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  35.25 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  32.61 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  43.3 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  43.04 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  28.65 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  34.85 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  35.51 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  25.74 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  26.85 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  38.21 
 
 
1048 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  30.8 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  37.82 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  25.7 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  43.04 
 
 
217 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  42.34 
 
 
157 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  41.44 
 
 
162 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  45 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  41.25 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  27.9 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  50 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  40 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  37.62 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  32.46 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  36.61 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  40 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  29.58 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.2 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  31.65 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.77 
 
 
176 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  29.96 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  37.9 
 
 
183 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  40.19 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  37.11 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  34.19 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  47.06 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  35.92 
 
 
148 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  28.14 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
155 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  41.84 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  37.62 
 
 
159 aa  67.4  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  31.56 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  40.86 
 
 
535 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  37.74 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  33.62 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  39.09 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0033  NLP/P60 protein  24.71 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  32.35 
 
 
183 aa  67  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  43.18 
 
 
370 aa  67  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>