More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4198 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  100 
 
 		 285 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  92.93 
 
 		 285 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  68.57 
 
 		 286 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  63.35 
 
 		 288 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  53.85 
 
 		 290 aa  316  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  53.85 
 
 		 290 aa  316  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  54.58 
 
 		 286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  52.96 
 
 		 286 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  47.18 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  51.12 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  50.75 
 
 		 286 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  47.74 
 
 		 286 aa  244  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  49.63 
 
 		 286 aa  242  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  50.57 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  51.11 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  48.34 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  45.88 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  49.43 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  45.94 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  46.13 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  45.79 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  47.91 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  44.28 
 
 		 289 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  43.66 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  42.25 
 
 		 281 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  44.52 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  40.15 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  41.64 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  43.57 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  43.01 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  43.01 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  39.78 
 
 		 279 aa  168  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  37.86 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  41.67 
 
 		 246 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2708  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  38.66 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  39.71 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  32.81 
 
 		 385 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  31.49 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  27.93 
 
 		 335 aa  92  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  27.13 
 
 		 250 aa  87.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  29.03 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  28.02 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  28.02 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  31.11 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  27.27 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  27.54 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  27.54 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  27.54 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  27.34 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  26.57 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  27.35 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  27.54 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  26.84 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  30.47 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  28.81 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  25 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  26.41 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  26.6 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  27.83 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  27.78 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  32.38 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  25.81 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  24.22 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 154 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.66 
 
 		 556 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  36.19 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  33.65 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  33.65 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  33.65 
 
 		 154 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  32.69 
 
 		 154 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.5 
 
 		 235 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  33.65 
 
 		 164 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  33.01 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  36.19 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  32.69 
 
 		 159 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  32.69 
 
 		 159 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  32.69 
 
 		 159 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 524 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  41.79 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  40 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  30.83 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  32.32 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  32.04 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0403  Nlp/P60 family protein  23.95 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000865774  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  34.33 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  42.53 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 535 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.45 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  31.37 
 
 		 150 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  40.86 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  33.58 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2656  NLP/P60 protein  40.51 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.939952  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  33.58 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  33.68 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3470  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0763319  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2633  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  31.07 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>