More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1954 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  100 
 
 		 259 aa  540  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  43.3 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  40.78 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  37.74 
 
 		 263 aa  171  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1813  NLP/P60 protein  34.63 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  27.06 
 
 		 345 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  31.6 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  29.2 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  28.33 
 
 		 333 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  27.66 
 
 		 333 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  28.33 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  28.51 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  28.26 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  30.6 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  27.9 
 
 		 333 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  28.07 
 
 		 333 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  27.9 
 
 		 333 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  30.26 
 
 		 283 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  26.69 
 
 		 333 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  26.69 
 
 		 333 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  31 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  30.13 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  28.16 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  28.68 
 
 		 303 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  44.21 
 
 		 349 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  27.71 
 
 		 333 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  43.14 
 
 		 342 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 246 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  47.13 
 
 		 246 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  39.83 
 
 		 335 aa  85.1  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  27.36 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  28.08 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  26.81 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  25.87 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  41.76 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  32 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  42.11 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  30.71 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  29.36 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  33.81 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  42 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  42.11 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  27.31 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  27.62 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  27.43 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  28.17 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  42.57 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  26.97 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  35.96 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  27.73 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.18 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  27.73 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  32.71 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  34.95 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  35.92 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  33.83 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  33.64 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  26.91 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  36.13 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  28.1 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  44.05 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  34.51 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  37.76 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  37.88 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  34.95 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  33.98 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  30.88 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  26.64 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  27.44 
 
 		 337 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  26.32 
 
 		 346 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  37.39 
 
 		 175 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  35.38 
 
 		 170 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  39.58 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  33.98 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  39.58 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  40.43 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  37.89 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  38 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  39.45 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  34.95 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  40.7 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  36.08 
 
 		 419 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  26.61 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  28.63 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  39.6 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  27.83 
 
 		 285 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1164  NLP/P60 protein  32.08 
 
 		 171 aa  72  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  25.99 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  42.53 
 
 		 181 aa  71.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  34.65 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  35.65 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  42.05 
 
 		 385 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>