More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1164 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1164  NLP/P60 protein  100 
 
 		 171 aa  338  2e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  70.79 
 
 		 175 aa  227  5e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  46.03 
 
 		 424 aa  111  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  40.17 
 
 		 342 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  40.17 
 
 		 342 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  38.79 
 
 		 342 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  40.17 
 
 		 346 aa  104  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  50.88 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 		 341 aa  101  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  37.72 
 
 		 347 aa  98.6  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  39.64 
 
 		 246 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 278 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  34.35 
 
 		 267 aa  95.5  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  34.65 
 
 		 269 aa  95.5  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  34.55 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  35.34 
 
 		 349 aa  94.4  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.79 
 
 		 332 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  37.69 
 
 		 257 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  32.8 
 
 		 269 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  34.46 
 
 		 265 aa  93.6  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  38.68 
 
 		 452 aa  94  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  43.44 
 
 		 370 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  36.44 
 
 		 338 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  36.75 
 
 		 234 aa  92.8  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  36.75 
 
 		 218 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  36.75 
 
 		 218 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  36.75 
 
 		 218 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  36.75 
 
 		 218 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  36.75 
 
 		 234 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  35.25 
 
 		 246 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  36.75 
 
 		 234 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  33.6 
 
 		 266 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  36.44 
 
 		 207 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  36.75 
 
 		 234 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 274 aa  92  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  35.9 
 
 		 224 aa  91.3  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  31.47 
 
 		 307 aa  91.7  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  40.17 
 
 		 170 aa  91.3  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 235 aa  91.3  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  35.51 
 
 		 333 aa  91.3  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  35.51 
 
 		 273 aa  91.3  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  36.64 
 
 		 181 aa  90.9  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 476 aa  90.9  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  32.67 
 
 		 454 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  35.9 
 
 		 223 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  36.13 
 
 		 224 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  35.9 
 
 		 223 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  35.9 
 
 		 223 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  35.9 
 
 		 223 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  35.9 
 
 		 223 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  35.04 
 
 		 221 aa  89  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 341 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  35.04 
 
 		 223 aa  89  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  35.04 
 
 		 221 aa  89  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  36.44 
 
 		 333 aa  88.6  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 205 aa  88.2  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  31.58 
 
 		 202 aa  88.6  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  45.98 
 
 		 214 aa  88.2  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 150 aa  87.4  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  35.19 
 
 		 331 aa  87.4  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 240 aa  86.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  40 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  39.82 
 
 		 236 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 319 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  36.09 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  41.05 
 
 		 217 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  34.06 
 
 		 285 aa  86.7  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  43.18 
 
 		 207 aa  86.3  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  38.98 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 301 aa  85.5  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.68 
 
 		 438 aa  84.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 284 aa  84.7  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  36.61 
 
 		 230 aa  84.7  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  34.45 
 
 		 450 aa  84.3  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1233  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 214 aa  84.3  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.783126  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  32.3 
 
 		 216 aa  84.3  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  39.47 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  39.47 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  43.96 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  43.96 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  39.47 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  39.47 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  39.47 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  39.47 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  39.47 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  30.99 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1100  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  41.3 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  32.2 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  38.6 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  29.41 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  29.41 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  31.48 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  34.82 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  27.5 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  29.7 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>