More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1116 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  100 
 
 		 294 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  79.86 
 
 		 294 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  67.14 
 
 		 286 aa  362  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  67.49 
 
 		 286 aa  362  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  69.15 
 
 		 286 aa  357  9e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  66.08 
 
 		 286 aa  353  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  57.95 
 
 		 286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  55.94 
 
 		 288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  61.07 
 
 		 279 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  58.36 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  56.79 
 
 		 281 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  53.71 
 
 		 281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  54.77 
 
 		 303 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  54.39 
 
 		 281 aa  281  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  55.56 
 
 		 294 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  51.43 
 
 		 289 aa  278  7e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  50.7 
 
 		 286 aa  255  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  50.71 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  51.48 
 
 		 286 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  47.87 
 
 		 290 aa  242  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  47.87 
 
 		 290 aa  242  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  48.57 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  50 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  50.36 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  46.04 
 
 		 283 aa  228  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  44.13 
 
 		 278 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  44.33 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  47.78 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 284 aa  219  5e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  50.18 
 
 		 279 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2708  NLP/P60 protein  45.68 
 
 		 282 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  43.43 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  43.17 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  41.79 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  45 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 270 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  42.49 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  28.69 
 
 		 250 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  31.65 
 
 		 385 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  29.96 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  30.04 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  28.36 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  26.88 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  27.08 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  27.27 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  27.27 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  26.03 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  27.27 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  27.27 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  27.27 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  26.45 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  26.45 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  25.65 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  26.03 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  27.71 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  24.9 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  24 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  26.14 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  46.3 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  27.69 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  32.8 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  31.06 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  34.21 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1988  hypothetical protein  40.19 
 
 		 242 aa  67  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150353  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.56 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  41.35 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  28.08 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  34.58 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  35.59 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  41.98 
 
 		 524 aa  65.9  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  39.22 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  34.45 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  35.04 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  31.2 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  39.36 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  36.11 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  34.17 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  34.17 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  36.27 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  37.89 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  23.93 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  33.06 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  30.91 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  34.41 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23421  hypothetical protein  44.71 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2656  NLP/P60 protein  33.96 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.939952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  35.92 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  22.12 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  34.75 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  40.43 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2073  NLP/P60 protein  34.21 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  39.6 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.44 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0007  nlp/p60 family protein  35.71 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0241644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  35.45 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  49.37 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.77 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.68 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>