More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1988 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1988  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  502  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150353  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0340  hypothetical protein  69.42 
 
 		 242 aa  360  1e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.979493  normal  0.0626014 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23421  hypothetical protein  60.64 
 
 		 250 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16421  hypothetical protein  46.28 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19631  hypothetical protein  44.98 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.333076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1088  cell wall-associated hydrolase  43.78 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.96576  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1610  hypothetical protein  41.07 
 
 		 252 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.836326  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2073  NLP/P60 protein  44.17 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2656  NLP/P60 protein  43.5 
 
 		 225 aa  186  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.939952  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17221  hypothetical protein  40.79 
 
 		 252 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17101  hypothetical protein  38.67 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2633  NLP/P60 protein  41.81 
 
 		 231 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16981  hypothetical protein  36.97 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.227275  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3470  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 231 aa  174  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0763319  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3396  NLP/P60  41.44 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0825  hypothetical protein  43.58 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0870  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  37.93 
 
 		 292 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  36.54 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  40.4 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.76 
 
 		 265 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  35.4 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  40 
 
 		 232 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  36.04 
 
 		 495 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  44.87 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  40.96 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  30.41 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  32 
 
 		 341 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 342 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.86 
 
 		 332 aa  65.1  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  32.2 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  40.48 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  31.93 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  40.24 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  26.81 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  31.29 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  39.05 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  35.14 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  40.7 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  30.83 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  34.21 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  30.89 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.29 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  28.99 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  30.08 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  30.08 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  36 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  37.35 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  30.89 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  39.76 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  33.03 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  33.03 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  34.21 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  33.62 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.84 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  40 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  39.25 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  36.26 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  37.21 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  39.33 
 
 		 334 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  31.91 
 
 		 487 aa  58.5  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  38.55 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  37 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  35.8 
 
 		 331 aa  58.5  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  38.36 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  40.4 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  37.35 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  34 
 
 		 193 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  24.88 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  40.4 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  33.96 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  34.18 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  31.09 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  39.08 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  28.69 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  38.27 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  28.46 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  29.36 
 
 		 147 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  34.19 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  33.03 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  36 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  28.46 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  40 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  37.35 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  30.58 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>