More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0340 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0340  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.979493  normal  0.0626014 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1988  hypothetical protein  69.42 
 
 		 242 aa  360  1e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150353  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23421  hypothetical protein  56.22 
 
 		 250 aa  288  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16421  hypothetical protein  47.33 
 
 		 250 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19631  hypothetical protein  44.05 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.333076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1088  cell wall-associated hydrolase  43.37 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.96576  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2656  NLP/P60 protein  45.5 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.939952  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1610  hypothetical protein  39.91 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.836326  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2073  NLP/P60 protein  42.39 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2633  NLP/P60 protein  44.19 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17221  hypothetical protein  39.82 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17101  hypothetical protein  38.67 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3470  NLP/P60 protein  44.19 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0763319  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3396  NLP/P60  43.84 
 
 		 234 aa  178  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0825  hypothetical protein  45.41 
 
 		 232 aa  177  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16981  hypothetical protein  37.05 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.227275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0870  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  38.17 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  41.38 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  28.17 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  28.29 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  48.65 
 
 		 116 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.14 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  32.31 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  42.57 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  34.96 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  34.23 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  37.86 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  27.32 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  34.62 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  40.24 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  31.41 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  38.79 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  34.15 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  38.46 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.37 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  31.45 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  30.89 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  30.99 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  37 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  36.89 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  38.24 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  34.19 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  38.46 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  30.89 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  31.15 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  35.14 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  38.24 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  35.25 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.55 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  38.2 
 
 		 307 aa  62  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  34.4 
 
 		 165 aa  62  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.66 
 
 		 270 aa  62  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 202 aa  62  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  26.98 
 
 		 370 aa  61.6  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  34.65 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  36.07 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  36.07 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  36.07 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  36.07 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  36.07 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  36.07 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  36.07 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  38.14 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  34.85 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  39.51 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  33.86 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  40 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  40 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  34.43 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  38 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  34.43 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  40 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  34.43 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  39.09 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  35 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  31.01 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  35.42 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  34.65 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  30.51 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  41.25 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  38 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  38 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  40 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  38 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>