More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0825 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0825  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  475  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3396  NLP/P60  54.55 
 
 		 234 aa  245  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2656  NLP/P60 protein  53.88 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.939952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2073  NLP/P60 protein  49.17 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2633  NLP/P60 protein  49.07 
 
 		 231 aa  211  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3470  NLP/P60 protein  48.61 
 
 		 231 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0763319  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0870  NLP/P60 protein  47.96 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0340  hypothetical protein  45.41 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.979493  normal  0.0626014 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16421  hypothetical protein  42.11 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1988  hypothetical protein  43.58 
 
 		 242 aa  175  7e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150353  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23421  hypothetical protein  46.64 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19631  hypothetical protein  38.26 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.333076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1088  cell wall-associated hydrolase  37.83 
 
 		 250 aa  168  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.96576  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1610  hypothetical protein  36.89 
 
 		 252 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.836326  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16981  hypothetical protein  35.11 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.227275  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17221  hypothetical protein  34.93 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17101  hypothetical protein  35.24 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  40.58 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  28.81 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  41.58 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  24.9 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 495 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  38.14 
 
 		 292 aa  71.6  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  34.02 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  43.33 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  41.75 
 
 		 349 aa  68.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  35.09 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  31.2 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  43.18 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  26.29 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  44.05 
 
 		 116 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  39.76 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  33.09 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  42 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  37.27 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  33.91 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  39.18 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  44.09 
 
 		 340 aa  65.5  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  40 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  38.54 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.66 
 
 		 303 aa  65.1  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.04 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  48.65 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  30.57 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  40 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  34.25 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  27.69 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  43.59 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  43.82 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  39.8 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  32.92 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  40.45 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  34.86 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.93 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  37.72 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1164  NLP/P60 protein  36.14 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  41.98 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.67 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  38.96 
 
 		 368 aa  62  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  37.78 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  43.02 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  26.19 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  31.82 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  33.06 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  33.06 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  38.24 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  27.38 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  27.38 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  32.04 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1813  NLP/P60 protein  25.85 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  27.38 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  31.15 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  42.11 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  27.38 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  27.38 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  35.38 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  27.98 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.6 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  28.89 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  36.79 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  27.38 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  35.63 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  37.37 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  35.29 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  33.64 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  37.14 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  36.71 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  32.48 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  34.23 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  36.71 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  36.71 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  36.71 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  37.01 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>