More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0870 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0870  NLP/P60 protein  100 
 
 
232 aa  487  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2633  NLP/P60 protein  63.88 
 
 
231 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3470  NLP/P60 protein  63 
 
 
231 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0763319  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3396  NLP/P60  56.62 
 
 
234 aa  251  9.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284891  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2656  NLP/P60 protein  56.48 
 
 
225 aa  244  8e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.939952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2073  NLP/P60 protein  46.61 
 
 
273 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0825  hypothetical protein  47.96 
 
 
232 aa  186  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16421  hypothetical protein  43.36 
 
 
250 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0340  hypothetical protein  41.82 
 
 
242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.979493  normal  0.0626014 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1988  hypothetical protein  43.4 
 
 
242 aa  162  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150353  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19631  hypothetical protein  38.22 
 
 
250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.333076  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23421  hypothetical protein  41.48 
 
 
250 aa  161  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1088  cell wall-associated hydrolase  38.77 
 
 
250 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.96576  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1610  hypothetical protein  34.5 
 
 
252 aa  138  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.836326  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17101  hypothetical protein  34.48 
 
 
252 aa  138  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16981  hypothetical protein  34.91 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.227275  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17221  hypothetical protein  34.06 
 
 
252 aa  134  9e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  43.16 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  31.5 
 
 
385 aa  78.2  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  33.9 
 
 
345 aa  75.9  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  47.44 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  37.86 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  33.96 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  36.67 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  35.09 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  38.14 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  35.19 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.75 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  43.04 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  42.5 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  39.78 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  30.77 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.05 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  34.55 
 
 
230 aa  68.2  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  34.86 
 
 
265 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  31.93 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  40.38 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  40 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  30.23 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.24 
 
 
303 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  30.83 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.42 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  37.61 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.21 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  37.93 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  28.48 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  32.48 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  38.37 
 
 
432 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  34.78 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  41.77 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  33.96 
 
 
391 aa  65.1  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  35.34 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  39.74 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  36.78 
 
 
284 aa  65.1  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  29.51 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
334 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  31.9 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  21.81 
 
 
476 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  35.34 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  27.57 
 
 
309 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  42.67 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  35.45 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  35.42 
 
 
191 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  38.1 
 
 
333 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  35.87 
 
 
333 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  35.34 
 
 
208 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  30 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  28.81 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  35.34 
 
 
207 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  35 
 
 
314 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  33.68 
 
 
235 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  38.1 
 
 
333 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
269 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  35.45 
 
 
205 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  31.58 
 
 
211 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.5 
 
 
332 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  38.1 
 
 
333 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  28.16 
 
 
333 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  28.16 
 
 
333 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  37.97 
 
 
333 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
419 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  41.56 
 
 
319 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  27.78 
 
 
370 aa  62.8  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  34.38 
 
 
207 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  25.79 
 
 
249 aa  62.4  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  35.45 
 
 
495 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
236 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  34.38 
 
 
205 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  29.09 
 
 
374 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  31.48 
 
 
217 aa  62.4  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  31.62 
 
 
187 aa  62.4  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  29.75 
 
 
193 aa  62.4  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  32.26 
 
 
384 aa  62.4  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  34.52 
 
 
365 aa  62  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  37.97 
 
 
398 aa  62  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  37.8 
 
 
260 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  39.47 
 
 
347 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  40.22 
 
 
487 aa  62.4  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  34.52 
 
 
365 aa  62  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>