More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1610 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1610  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.836326  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17221  hypothetical protein  83.73 
 
 
252 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17101  hypothetical protein  82.94 
 
 
252 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16981  hypothetical protein  66.27 
 
 
251 aa  360  9e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.227275  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16421  hypothetical protein  44.4 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1988  hypothetical protein  41.07 
 
 
242 aa  190  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150353  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23421  hypothetical protein  39.21 
 
 
250 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19631  hypothetical protein  41.53 
 
 
250 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.333076  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0340  hypothetical protein  39.91 
 
 
242 aa  188  7e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.979493  normal  0.0626014 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1088  cell wall-associated hydrolase  40.89 
 
 
250 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.96576  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2656  NLP/P60 protein  38.22 
 
 
225 aa  160  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.939952  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3470  NLP/P60 protein  37.72 
 
 
231 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0763319  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2633  NLP/P60 protein  37.72 
 
 
231 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0825  hypothetical protein  36.89 
 
 
232 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3396  NLP/P60  38.01 
 
 
234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284891  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2073  NLP/P60 protein  31.92 
 
 
273 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0870  NLP/P60 protein  34.5 
 
 
232 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  47.62 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  32.11 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  26.73 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  37.17 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  31.15 
 
 
370 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  33.71 
 
 
349 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  34.48 
 
 
174 aa  63.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  37.78 
 
 
334 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.37 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  38.1 
 
 
207 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  36.96 
 
 
424 aa  62  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  34.78 
 
 
331 aa  62  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  37.36 
 
 
340 aa  62  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  32.54 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  39.33 
 
 
308 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  37.8 
 
 
345 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  41.05 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  35.85 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  45.88 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  36.78 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  35.85 
 
 
205 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  39.53 
 
 
373 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
335 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  32.52 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  38.2 
 
 
372 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  38.2 
 
 
372 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  25 
 
 
231 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  33.68 
 
 
116 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
230 aa  59.3  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  37.5 
 
 
393 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  38.2 
 
 
372 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  42.05 
 
 
333 aa  58.9  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  42.05 
 
 
333 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  42.05 
 
 
333 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  40.24 
 
 
182 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  31.3 
 
 
266 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  36.79 
 
 
390 aa  58.5  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  35.64 
 
 
391 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  38.71 
 
 
348 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  39.77 
 
 
333 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  38.2 
 
 
370 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  38.71 
 
 
363 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  38.71 
 
 
363 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  27.87 
 
 
188 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  35.96 
 
 
419 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  42.05 
 
 
333 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  37.23 
 
 
162 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  38.78 
 
 
333 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  42.05 
 
 
333 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  37.5 
 
 
309 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  37.62 
 
 
173 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  38.2 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  42.7 
 
 
333 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  38.89 
 
 
188 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  40.91 
 
 
333 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  38.27 
 
 
368 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  33.71 
 
 
385 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  37.35 
 
 
292 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  35.96 
 
 
175 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.27 
 
 
332 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  36.63 
 
 
392 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  37.63 
 
 
348 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  28.32 
 
 
452 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  26.58 
 
 
302 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  36.67 
 
 
177 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  37.63 
 
 
348 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  38.96 
 
 
392 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  36.67 
 
 
198 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  39.47 
 
 
346 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  37.63 
 
 
363 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  38.64 
 
 
333 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  31.91 
 
 
364 aa  55.8  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  35 
 
 
378 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  34.48 
 
 
319 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  30.77 
 
 
345 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.71 
 
 
292 aa  55.5  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  37.5 
 
 
487 aa  55.5  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  37.8 
 
 
368 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  36.78 
 
 
319 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  39.47 
 
 
495 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  37.04 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  36.56 
 
 
361 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>