More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_23421 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_23421  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1988  hypothetical protein  60.64 
 
 
242 aa  306  3e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150353  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0340  hypothetical protein  56.22 
 
 
242 aa  288  7e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.979493  normal  0.0626014 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16421  hypothetical protein  50.6 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19631  hypothetical protein  44.58 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.333076  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1088  cell wall-associated hydrolase  44.18 
 
 
250 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.96576  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17221  hypothetical protein  39.65 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1610  hypothetical protein  39.21 
 
 
252 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.836326  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2073  NLP/P60 protein  44.71 
 
 
273 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17101  hypothetical protein  38.77 
 
 
252 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16981  hypothetical protein  37.95 
 
 
251 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.227275  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2656  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
225 aa  182  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.939952  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2633  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
231 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3470  NLP/P60 protein  44.02 
 
 
231 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0763319  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3396  NLP/P60  42.79 
 
 
234 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284891  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0825  hypothetical protein  46.09 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0870  NLP/P60 protein  41.48 
 
 
232 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  45.92 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  43.68 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  44.05 
 
 
335 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  39.64 
 
 
495 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47.56 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  50 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  39.53 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  36.89 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  36.97 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  44.83 
 
 
366 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.86 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  45.12 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
476 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  45.68 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  38.1 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.5 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  33.77 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  43.9 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  38.74 
 
 
480 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  40.48 
 
 
333 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  36.27 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  39.77 
 
 
333 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  39.77 
 
 
333 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  39.77 
 
 
333 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  39.77 
 
 
333 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  33.9 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  39.77 
 
 
333 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  42.22 
 
 
293 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  39.77 
 
 
333 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  31.67 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  45.78 
 
 
372 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  45.78 
 
 
372 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  41.46 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.61 
 
 
222 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  40.45 
 
 
350 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  36.08 
 
 
333 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
116 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  41.77 
 
 
395 aa  64.3  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  35 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  35.97 
 
 
424 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  45.78 
 
 
372 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  34.45 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  33.33 
 
 
342 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  38.64 
 
 
333 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  40.91 
 
 
333 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  39.47 
 
 
346 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  37.93 
 
 
175 aa  63.5  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
202 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  38.64 
 
 
333 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  34.07 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.1 
 
 
303 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  37.37 
 
 
193 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  44.16 
 
 
370 aa  63.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  39.8 
 
 
378 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  37.37 
 
 
205 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  36.78 
 
 
385 aa  62.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  44.19 
 
 
294 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  32.54 
 
 
487 aa  62.4  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  39.22 
 
 
263 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  38.61 
 
 
162 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
188 aa  62  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  37.76 
 
 
337 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  43.33 
 
 
181 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  37.9 
 
 
340 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  37.35 
 
 
307 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  34.15 
 
 
341 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  39.08 
 
 
432 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  36.43 
 
 
173 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1164  NLP/P60 protein  36.78 
 
 
171 aa  61.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  46.34 
 
 
319 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.24 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  34.68 
 
 
174 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  36 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  39.51 
 
 
368 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  41.98 
 
 
326 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  33.65 
 
 
173 aa  60.5  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  41.25 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  38.37 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  36.73 
 
 
207 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  30.77 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  43.33 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  43.04 
 
 
1048 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
391 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>