More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0388 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  100 
 
 		 480 aa  917    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  68.99 
 
 		 495 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  28.4 
 
 		 491 aa  121  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 319 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  45.87 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50 
 
 		 292 aa  95.1  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 204 aa  93.6  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  47.96 
 
 		 374 aa  93.6  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  44.25 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 308 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.93 
 
 		 438 aa  90.1  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  42.99 
 
 		 502 aa  89.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  45.54 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  47.47 
 
 		 345 aa  87  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  39.25 
 
 		 432 aa  86.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.17 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  46.24 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  38.21 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  46.92 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  47.12 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.62 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 333 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  46 
 
 		 367 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  43.01 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  41.75 
 
 		 293 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  40 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  43.56 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  45.76 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  48.04 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  46.81 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  48.04 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  36.45 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.04 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.26 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.59 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  45.71 
 
 		 368 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  48.91 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 348 aa  79.7  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 162 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  47 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  44.57 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  40.59 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  36.94 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  38.66 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  48.48 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  38.6 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  40.59 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  44.55 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  46.24 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  48.91 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.19 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  38.02 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.21 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  44.57 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 347 aa  76.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  42 
 
 		 188 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  45.19 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  42 
 
 		 188 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  38.05 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.05 
 
 		 176 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  35.24 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 269 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  43.18 
 
 		 182 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  45.56 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 199 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.26 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  39.45 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  45.98 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  40.44 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  45.98 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  34 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  28.64 
 
 		 1048 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  52.33 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  42.2 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  45.16 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  40 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  38.66 
 
 		 181 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  42.02 
 
 		 174 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  45.92 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 256 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 256 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>