More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11858 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  100 
 
 		 249 aa  521  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  60.32 
 
 		 253 aa  315  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1813  NLP/P60 protein  45.97 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  41.09 
 
 		 263 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  40.78 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  29.67 
 
 		 385 aa  97.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  31.84 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  29.03 
 
 		 309 aa  96.3  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  48.96 
 
 		 318 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  29.41 
 
 		 292 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  31.49 
 
 		 335 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  29 
 
 		 289 aa  89.4  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  27.48 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  46.53 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  27.23 
 
 		 295 aa  86.7  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  27.4 
 
 		 279 aa  85.5  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  26.35 
 
 		 345 aa  85.5  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  29.36 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  28.9 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  32.89 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  38.79 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  25 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  26.09 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  24.6 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  24.6 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  29.74 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  24.6 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  24.6 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  25.3 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  25.3 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  24.6 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  27.78 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  25.11 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  27.59 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  28.11 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  24.18 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  27.84 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  26.41 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  25.97 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  37.25 
 
 		 1048 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  37 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  26.24 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  39 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  38.6 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  39.25 
 
 		 391 aa  75.9  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  28.74 
 
 		 424 aa  75.5  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  38.18 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  24.34 
 
 		 286 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  25.66 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.67 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  38.18 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  33.14 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  26.29 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  25.66 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  27.09 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  28.76 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  23.39 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  41.67 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  24 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  38.83 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  39.8 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  25 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  31.16 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  25.22 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 183 aa  72  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  26.72 
 
 		 298 aa  72  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  36.28 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  27.95 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 524 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  27.95 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  43.21 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  32.71 
 
 		 175 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  40.91 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  28.38 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  36.89 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  26.7 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  37.96 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  37.62 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  32.26 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.39 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  41.49 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 532 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  37.74 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  25.79 
 
 		 532 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  40.57 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  32.2 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  28.99 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  28.99 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  32.35 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  39.78 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  28.99 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  30.4 
 
 		 348 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  28.99 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  28.99 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>