More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3201 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  100 
 
 		 260 aa  539  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  46.33 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  42.42 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  43.3 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 263 aa  208  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1813  NLP/P60 protein  39.92 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  29.07 
 
 		 335 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  30.23 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  30.43 
 
 		 250 aa  89.4  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  30.04 
 
 		 294 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  28.24 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  29.57 
 
 		 385 aa  86.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  28.27 
 
 		 286 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  31.47 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  32.77 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  32.77 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  27.74 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  26.79 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  29.53 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  29.05 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  26.21 
 
 		 333 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  25.79 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  28.22 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  32.48 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  25.79 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  28.87 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  25.79 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  45.92 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  28.41 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  25.79 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  25.79 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  25.79 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  25 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  25 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  25 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  27.27 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  28.46 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  31.43 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  27.07 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  30 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  31.62 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  24.61 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  30.47 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  40.37 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  28.93 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  27.08 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  35.04 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  41.07 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  41.49 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  37.17 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  37.62 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  43.88 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  26.92 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  41.3 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  30 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  27.71 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  37.62 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  29.05 
 
 		 290 aa  72  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  29.05 
 
 		 290 aa  72  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  27.54 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  27.51 
 
 		 235 aa  72  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  38.39 
 
 		 1048 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.69 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  29.15 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  27.35 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  40.21 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  30.09 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  40 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  33.13 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  39.18 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  24.34 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2073  NLP/P60 protein  39.05 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  37.1 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  26.14 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  28.44 
 
 		 532 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  26.81 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  29.05 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0825  hypothetical protein  28.81 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  42.72 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  44.05 
 
 		 327 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  36.63 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  34.65 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  29.68 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  45.68 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  26.45 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.77 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  37.6 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  35.64 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 177 aa  68.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  28.44 
 
 		 532 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>