More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0670 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  100 
 
 		 207 aa  423  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2940  NLP/P60 protein  50.68 
 
 		 217 aa  206  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.284799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  38.03 
 
 		 174 aa  111  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  34.69 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  35.17 
 
 		 165 aa  99  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  40 
 
 		 168 aa  98.6  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  36.97 
 
 		 188 aa  94.7  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 155 aa  93.2  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1158  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  38.14 
 
 		 302 aa  92.8  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  37.36 
 
 		 269 aa  92  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 333 aa  91.7  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 269 aa  91.3  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  41.53 
 
 		 154 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 154 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 154 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  41.53 
 
 		 154 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  40.68 
 
 		 154 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  40.68 
 
 		 154 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  40.68 
 
 		 154 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  39.68 
 
 		 154 aa  89.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  39.68 
 
 		 154 aa  89.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  40.68 
 
 		 154 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  40.68 
 
 		 154 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  43.97 
 
 		 154 aa  89  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  39.68 
 
 		 143 aa  89.4  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  40.68 
 
 		 154 aa  89  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  40.68 
 
 		 154 aa  88.6  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  40.68 
 
 		 154 aa  89  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  40.68 
 
 		 154 aa  89  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  40.68 
 
 		 154 aa  89  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 154 aa  88.2  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  36.65 
 
 		 154 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  41.22 
 
 		 274 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  32.3 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 157 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  39.82 
 
 		 162 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  38.14 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  38.21 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  40.3 
 
 		 150 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  36.92 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  36.42 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  39.83 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  38.22 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  30.33 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  42.37 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  40.35 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  35.43 
 
 		 370 aa  81.6  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  40.94 
 
 		 342 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  35.16 
 
 		 384 aa  81.3  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  35 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  40 
 
 		 168 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  36.22 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  29.33 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  36.71 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  37.84 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  36.22 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  36.22 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  37.89 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  37.89 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  31.54 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  37.89 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  37.89 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  39.68 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  38.46 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  37.89 
 
 		 407 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  37.89 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  54.41 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  37.89 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  37.89 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 418 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  37.41 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  37.41 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  37.41 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  40.94 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  35.93 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  40.94 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 338 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  37.41 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  37.41 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  37.41 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  37.41 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 342 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  39.68 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  30.97 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 391 aa  78.2  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  37.18 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  43.8 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  40 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  39.56 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  37.6 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2523  NLP/P60 protein  36.72 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000113171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  31.46 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  39.02 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>