More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0244 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  100 
 
 		 289 aa  591  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  51.43 
 
 		 294 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  51.07 
 
 		 286 aa  258  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  50.71 
 
 		 286 aa  257  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  48.03 
 
 		 286 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  46.13 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  50 
 
 		 286 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  50 
 
 		 279 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  49.12 
 
 		 286 aa  245  8e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  48.03 
 
 		 283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  47.14 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  49.1 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  48.04 
 
 		 283 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  45.36 
 
 		 281 aa  235  8e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  44.81 
 
 		 290 aa  232  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  44.81 
 
 		 290 aa  232  7.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 286 aa  228  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  45.39 
 
 		 286 aa  228  9e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  45 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  45.36 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  46.76 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  44.13 
 
 		 281 aa  221  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  44.28 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  42.59 
 
 		 286 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 285 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  46.49 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  41.76 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  44.33 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  39.78 
 
 		 278 aa  202  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  43.11 
 
 		 279 aa  188  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  39.21 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  38.85 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  39.29 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2708  NLP/P60 protein  36.56 
 
 		 282 aa  165  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  39.1 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  38.52 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  32.76 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  31.7 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  29 
 
 		 249 aa  89.4  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  26.56 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  30.71 
 
 		 385 aa  85.9  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  27.36 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  27.8 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  28.87 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1813  NLP/P60 protein  27.9 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  32.61 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  24.56 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  33.78 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  40.66 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  40.45 
 
 		 524 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  26.38 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  37.25 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  27.35 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  26.94 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.41 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  41.23 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  26.94 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  28.45 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  23.7 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  26.94 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  26.94 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  26.94 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  37.29 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  25.71 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  36.28 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  26.23 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.05 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  26.23 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  26.24 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.93 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  36.19 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  25.62 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  34.51 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  26.12 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  40.91 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  40 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  30.63 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  33.68 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  36.21 
 
 		 388 aa  58.9  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  34.74 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  38.05 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  31.67 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  39.78 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  34.11 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.38 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  34.26 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.13 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  30.61 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  33.77 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  38.54 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  34.62 
 
 		 1048 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>