More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7040 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  100 
 
 		 279 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  65.47 
 
 		 294 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  66.79 
 
 		 281 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  64.54 
 
 		 283 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  65.11 
 
 		 303 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  61.7 
 
 		 281 aa  352  5e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  62.99 
 
 		 281 aa  348  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  55.96 
 
 		 279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  52.16 
 
 		 286 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  51.8 
 
 		 286 aa  268  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  49.46 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  47.72 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  52.11 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  47.86 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  49.3 
 
 		 286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  52.12 
 
 		 294 aa  248  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  46.67 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  44.33 
 
 		 289 aa  228  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  45.88 
 
 		 283 aa  225  7e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  41.95 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  42.5 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  42.59 
 
 		 285 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  40.67 
 
 		 286 aa  208  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  42.16 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  45.17 
 
 		 276 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  40.43 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  45.29 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  43.75 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  43.31 
 
 		 270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  46.02 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  42.91 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2708  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  39.43 
 
 		 306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  36.68 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  30.97 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  25.7 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  26.57 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  26.92 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  31.96 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  30.74 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  27.39 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  25.68 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  27.76 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  24.78 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1813  NLP/P60 protein  24.78 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  26.53 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  28.38 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  25.82 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  27.27 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  26.67 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  26.86 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  25 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  25 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  40.22 
 
 		 335 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  25.41 
 
 		 333 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  35.92 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  25 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.59 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  27.62 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.86 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  25 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  25 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  40.85 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  25.65 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  36.78 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  35.85 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  34.86 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  34.58 
 
 		 524 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  41.76 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.35 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  42.22 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  42.05 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  43.37 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  31.65 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  36.61 
 
 		 116 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  45.57 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  45.57 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  45.57 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  41.3 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  42.05 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  42.05 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.93 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  39.36 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0870  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  38.04 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.53 
 
 		 556 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_002620  TC0403  Nlp/P60 family protein  27.56 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000865774  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03920  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  29.09 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  37.37 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  42.05 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  32.71 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>