More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1380 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  547  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  99.26 
 
 		 270 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  88.15 
 
 		 270 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  45.26 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2708  NLP/P60 protein  50.92 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  49.79 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 281 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  43.88 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  43.01 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  43.57 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  42.81 
 
 		 286 aa  188  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  43.01 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  44.49 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  40.99 
 
 		 290 aa  185  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  40.99 
 
 		 290 aa  185  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  43.51 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  42.14 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  39.21 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  43.17 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  43.73 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  41.58 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  40.58 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  38.57 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  40 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  44.2 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  40.58 
 
 		 286 aa  175  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  41.57 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  39.86 
 
 		 286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  41.79 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  42.38 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  39.3 
 
 		 286 aa  168  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  38.77 
 
 		 312 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  36.79 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 294 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  37.39 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  37.6 
 
 		 295 aa  99  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  37.44 
 
 		 309 aa  98.6  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  29.78 
 
 		 345 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  29.05 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  26.84 
 
 		 250 aa  85.5  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  31.88 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  28.57 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  28.57 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  32.28 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  28.63 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  28.12 
 
 		 333 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  28.12 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  28.12 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  28.12 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  28.12 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  28.12 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  28.12 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  28.12 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  26.61 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  48.65 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.83 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  44.05 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  25.98 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  28.22 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  45.56 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  29.2 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.78 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  41.58 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  27.88 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  49.33 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  37.08 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  39.62 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  37.14 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  45.21 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  25.98 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  38.1 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  40.7 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.05 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  44.16 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  41.77 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  26.98 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  35.56 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  38.37 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  38.55 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  25.38 
 
 		 424 aa  59.3  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  34.91 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  41.57 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  42.22 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  42.22 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  38.64 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  38.67 
 
 		 524 aa  58.9  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>