More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0732 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  100 
 
 
286 aa  589  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  83.51 
 
 
290 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  83.51 
 
 
290 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  55.24 
 
 
286 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  56.84 
 
 
288 aa  319  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  52.96 
 
 
285 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  50.87 
 
 
285 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  51.41 
 
 
286 aa  292  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  48.6 
 
 
284 aa  275  5e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  46.81 
 
 
286 aa  242  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  46.81 
 
 
286 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  45.19 
 
 
286 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  46.81 
 
 
286 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  44.07 
 
 
289 aa  228  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  44.6 
 
 
286 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  45.02 
 
 
288 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  47.43 
 
 
279 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  44.66 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  46.81 
 
 
294 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  42.25 
 
 
281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  41.76 
 
 
278 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  38.73 
 
 
281 aa  202  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  40.43 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  38.87 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  39.08 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  40.15 
 
 
283 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  41.51 
 
 
276 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  37.76 
 
 
283 aa  190  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  44.63 
 
 
246 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  39.79 
 
 
270 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  36.04 
 
 
312 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  39.3 
 
 
271 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  38.73 
 
 
270 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  39.78 
 
 
279 aa  151  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2708  NLP/P60 protein  34.8 
 
 
282 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  35.87 
 
 
306 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  33.21 
 
 
295 aa  115  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  30.86 
 
 
385 aa  93.6  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  28.4 
 
 
250 aa  90.5  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  26.09 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  29.05 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  29.74 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  27.27 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  29.82 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  32.41 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  27.11 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  27.47 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  31.91 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  28.57 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  25.96 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  25.93 
 
 
333 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  25.51 
 
 
333 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  25.53 
 
 
292 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  25.51 
 
 
333 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  34.19 
 
 
210 aa  62  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  26.34 
 
 
333 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  25.51 
 
 
333 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  24.48 
 
 
335 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  26.09 
 
 
333 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  25.51 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  25.51 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  25.51 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  25.21 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
524 aa  59.3  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.23 
 
 
556 aa  58.9  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  36.14 
 
 
384 aa  59.3  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.43 
 
 
280 aa  58.9  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.27 
 
 
210 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  25.1 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  36.56 
 
 
317 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.45 
 
 
388 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  35.78 
 
 
535 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  37.35 
 
 
204 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  26.8 
 
 
208 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  32.84 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  26.29 
 
 
208 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0403  Nlp/P60 family protein  34.91 
 
 
281 aa  56.6  0.0000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000865774  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  26.8 
 
 
207 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  24.07 
 
 
424 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  34.86 
 
 
463 aa  56.6  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  31.62 
 
 
205 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  34.13 
 
 
370 aa  56.2  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  32.12 
 
 
419 aa  55.8  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.3 
 
 
372 aa  55.8  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  36.36 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  36.96 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  36.96 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.87 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  36.96 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  34.23 
 
 
212 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  35.65 
 
 
174 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  40.26 
 
 
174 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  32.8 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  32.46 
 
 
150 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  33.04 
 
 
188 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  31.71 
 
 
186 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1813  NLP/P60 protein  22.81 
 
 
258 aa  52.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4838  NLP/P60 protein  36 
 
 
359 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.11848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>