More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4584 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  100 
 
 		 276 aa  550  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  51.62 
 
 		 286 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  51.62 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  52.69 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  48.92 
 
 		 286 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  50.36 
 
 		 294 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  46.76 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  47.33 
 
 		 286 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  51.87 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  46.07 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  45.71 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  47.99 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  42.96 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  45.52 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  50.89 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  43.82 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  48.18 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  47.41 
 
 		 303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  45.52 
 
 		 294 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  43.36 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  43.36 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  43.06 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  44.52 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  41.16 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  44.88 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  44.65 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  44.36 
 
 		 312 aa  198  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  45.49 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  42.14 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  37.72 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2708  NLP/P60 protein  45.26 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  43.73 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  42.25 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  43.32 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  43.5 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  39.07 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  37.79 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  32.02 
 
 		 385 aa  94  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  27 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  28.33 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  32.48 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  26.91 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  42.17 
 
 		 524 aa  72.4  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  28.69 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 495 aa  68.9  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.34 
 
 		 556 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  29.52 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  25.1 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  50 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  35.64 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  35.14 
 
 		 333 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  33 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  36.78 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  28.9 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  37.86 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  29.14 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 175 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  24.88 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  32.35 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  38.61 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  31.3 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  32.48 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.14 
 
 		 438 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.08 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  28.66 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.77 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  31.73 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  31.73 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  28.24 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.3 
 
 		 388 aa  62.4  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  31.37 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  39 
 
 		 174 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  38 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  26.45 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.23 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  29.35 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  36.17 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  32.38 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  36.17 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  35.09 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3603  NLP/P60 protein  34.86 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  40.24 
 
 		 535 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  30.84 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  33.33 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  32.54 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  28.87 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  33.33 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  27.62 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  30.5 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  29.6 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  29.6 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  32.41 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  32 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  29.91 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  29.91 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  29.91 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>