More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2100 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  100 
 
 		 302 aa  608  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  46.67 
 
 		 186 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  45.65 
 
 		 165 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  45.74 
 
 		 174 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  47.33 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  36.79 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  31.58 
 
 		 346 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.64 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  31.13 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  42.77 
 
 		 214 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  42.77 
 
 		 212 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  43.33 
 
 		 154 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  45.13 
 
 		 154 aa  102  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  43.33 
 
 		 154 aa  102  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  43.33 
 
 		 154 aa  102  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  42.14 
 
 		 214 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  43.33 
 
 		 154 aa  102  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 208 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 154 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  41.09 
 
 		 155 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 168 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  39.2 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 162 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  32.5 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  42.5 
 
 		 154 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 154 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 154 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  42.5 
 
 		 154 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  42.48 
 
 		 154 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  38.28 
 
 		 156 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  42.5 
 
 		 154 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 210 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  42.5 
 
 		 154 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  40.32 
 
 		 159 aa  99.8  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  42.5 
 
 		 154 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  42.5 
 
 		 154 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  42.5 
 
 		 154 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  42.5 
 
 		 154 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 214 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  45.3 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 157 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  41.13 
 
 		 193 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  41.43 
 
 		 183 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  34.52 
 
 		 424 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  41.13 
 
 		 205 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 173 aa  97.1  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  43.2 
 
 		 226 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 196 aa  96.3  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 214 aa  95.9  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  41.79 
 
 		 150 aa  95.5  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  38.73 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  44.63 
 
 		 170 aa  95.5  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  38.6 
 
 		 162 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  40.3 
 
 		 210 aa  94.7  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 150 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  34.85 
 
 		 150 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  36.31 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  39.02 
 
 		 171 aa  94  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  37.11 
 
 		 349 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 		 188 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  37.19 
 
 		 188 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 		 188 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 		 188 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 		 188 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 		 188 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3275  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 181 aa  93.2  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 		 188 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  37.19 
 
 		 188 aa  93.2  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  37.19 
 
 		 188 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  36.89 
 
 		 207 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 207 aa  92.8  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  37.69 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  38.97 
 
 		 232 aa  92.4  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  39.82 
 
 		 143 aa  92  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  39.82 
 
 		 154 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  39.82 
 
 		 154 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  43.36 
 
 		 217 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  38.02 
 
 		 194 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 220 aa  92  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  39.58 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  38.02 
 
 		 193 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 188 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  38.33 
 
 		 179 aa  90.5  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  36 
 
 		 205 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0721  NLP/P60 family protein  37.78 
 
 		 202 aa  90.1  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 246 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  42.37 
 
 		 246 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 216 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  38.05 
 
 		 166 aa  89.7  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  31.97 
 
 		 162 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  42.11 
 
 		 231 aa  89.7  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 190 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 190 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  39.67 
 
 		 191 aa  89.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 190 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  39.67 
 
 		 191 aa  89.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  38.71 
 
 		 257 aa  89.7  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  37.07 
 
 		 184 aa  89.4  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>