More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0696 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0696  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  100 
 
 		 300 aa  590  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2196  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  53.28 
 
 		 490 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.800961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3112  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  48.18 
 
 		 496 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7871  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.03 
 
 		 508 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5534  hypothetical protein  42.11 
 
 		 676 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  46.72 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  48.8 
 
 		 523 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 232 aa  92.8  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  42.86 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  35.46 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.98 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 257 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 476 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  35.86 
 
 		 391 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  42.48 
 
 		 453 aa  85.5  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  36.29 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  40.31 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.83 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  38.33 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  40.38 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  47.47 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  36.36 
 
 		 1048 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  30.29 
 
 		 174 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  40.98 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 154 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  34.76 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  41.35 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 202 aa  81.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.38 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  42.59 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  37.6 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  40 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  39.23 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  37.84 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  35.83 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  45.54 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  37.7 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  34.29 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  35.07 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  37.7 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  38.02 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  46.24 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.14 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  45.65 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  36.22 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  39.52 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  42.54 
 
 		 556 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1933  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  36.43 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  41 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  41 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  35.83 
 
 		 150 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  37.6 
 
 		 181 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.74 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  41 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  41 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  41 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  40.57 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.9 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  41.07 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  41 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  41 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  41 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  41 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  35.16 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  39.32 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.02 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  48.54 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  39.32 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  46.88 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  36.03 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  35.71 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  38.21 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  38.68 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>