More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0122 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0122  NLP/P60 protein  100 
 
 		 264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2843  NLP/P60 protein  50.19 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  37.45 
 
 		 271 aa  129  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.61 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  47.52 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  45.87 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  36.5 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  37.89 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 524 aa  75.5  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.44 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  40.59 
 
 		 535 aa  73.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  39.5 
 
 		 487 aa  72.8  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  39.17 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  42.55 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  35.64 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  38.54 
 
 		 556 aa  69.3  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  34.55 
 
 		 532 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  34.55 
 
 		 532 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.45 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  31.85 
 
 		 536 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.21 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.33 
 
 		 372 aa  68.9  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09120  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.18 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  37.74 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  31.93 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  41.94 
 
 		 395 aa  67  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  40.66 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.84 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 391 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  29.55 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  36.45 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  37.36 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  40.45 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  30.47 
 
 		 1048 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  38.38 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  35.24 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  38 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  40.45 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  33.7 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  34.31 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  41.11 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  40.96 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  40.66 
 
 		 556 aa  63.5  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.98 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  44.58 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  34.41 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  37.37 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  37.27 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  32.35 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  35.79 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  36.19 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  36.19 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  32.67 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  34.58 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  36.75 
 
 		 392 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1665  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 194 aa  62  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  36.19 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  36.7 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  35.51 
 
 		 181 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4888  cell wall endopeptidase  43.02 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.76 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13270  hypothetical protein  41.35 
 
 		 389 aa  62  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  38.04 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  34.21 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  31.25 
 
 		 170 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4933  NLP/P60 protein  45.71 
 
 		 986 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  36 
 
 		 859 aa  60.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  36.7 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  36.04 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4873  cell wall endopeptidase  43.02 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  38.64 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  36.89 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5359  cell wall endopeptidase and peptidase, C40, NLP/P60 family fusion protein  39.05 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  30.12 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4838  NLP/P60 protein  36.19 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.11848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  32.46 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  30.51 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  32.61 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5301  endopeptidase lytE, putative  43.02 
 
 		 513 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  29.71 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  32.85 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  38.24 
 
 		 523 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  41.57 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  35.59 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  25.9 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  29.47 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  29.71 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  34.78 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>