More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5540 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5540  NLP/P60 protein  100 
 
 
473 aa  908    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5534  NLP/P60 protein  59.85 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  46.62 
 
 
388 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.95 
 
 
337 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  49.06 
 
 
197 aa  96.3  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  46.9 
 
 
432 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  41.29 
 
 
394 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  44.92 
 
 
331 aa  94.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  47.41 
 
 
432 aa  94  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
293 aa  94  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  47.41 
 
 
432 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  47.87 
 
 
232 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
452 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  40.65 
 
 
307 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  46.72 
 
 
306 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  47.86 
 
 
417 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  50.88 
 
 
447 aa  91.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
257 aa  91.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  44.96 
 
 
340 aa  91.3  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  44.63 
 
 
225 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  40.32 
 
 
278 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  42.14 
 
 
374 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  45.28 
 
 
524 aa  90.5  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  43.97 
 
 
265 aa  90.1  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.02 
 
 
438 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  40.32 
 
 
266 aa  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  40.83 
 
 
475 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  40.71 
 
 
284 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  40.83 
 
 
475 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47.46 
 
 
332 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  40.83 
 
 
475 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  39.84 
 
 
267 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
256 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  41.23 
 
 
388 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  45.97 
 
 
281 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  45.28 
 
 
333 aa  87.8  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  41.27 
 
 
256 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  41.13 
 
 
308 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  41.67 
 
 
467 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
467 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44 
 
 
235 aa  87  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  47.06 
 
 
398 aa  87  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
257 aa  87  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  38.33 
 
 
269 aa  87  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
257 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
257 aa  87  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  42.5 
 
 
469 aa  87  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
256 aa  87  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
256 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  41.27 
 
 
248 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  38.1 
 
 
269 aa  86.7  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  40.83 
 
 
472 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  46.02 
 
 
459 aa  86.7  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  46.43 
 
 
370 aa  86.7  9e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  43.22 
 
 
337 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
469 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
234 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  45.19 
 
 
334 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
164 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  41.32 
 
 
256 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  41.32 
 
 
256 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  46.53 
 
 
180 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
335 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  39.34 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  38.33 
 
 
472 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
476 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
469 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  40.35 
 
 
478 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
469 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  42.5 
 
 
256 aa  85.9  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  39.34 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  40.83 
 
 
467 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  39.34 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  39.34 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  39.34 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  40.83 
 
 
469 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  39.34 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  39.34 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  39.34 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  39.34 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  40.35 
 
 
479 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2050  NLP/P60 protein  44.23 
 
 
696 aa  84.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.426387  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  38.46 
 
 
170 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  49.47 
 
 
553 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
393 aa  84  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  43.52 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.37 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  48.11 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  43.85 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  44.23 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  42.02 
 
 
319 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  39.42 
 
 
324 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 
221 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  44.54 
 
 
333 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.7 
 
 
321 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  39.42 
 
 
283 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  37.61 
 
 
198 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  40.78 
 
 
487 aa  82.8  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>