More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2551 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  100 
 
 		 331 aa  669    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  80.19 
 
 		 327 aa  511  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  66.35 
 
 		 302 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  48.25 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  47.79 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  40.45 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.59 
 
 		 390 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  50.27 
 
 		 182 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.9 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  38.82 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  38.25 
 
 		 392 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  58.73 
 
 		 116 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.15 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  33.87 
 
 		 374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  48.12 
 
 		 199 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  44.81 
 
 		 231 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  42.07 
 
 		 429 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  48.06 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  47.33 
 
 		 190 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  45.31 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  51.4 
 
 		 417 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  50.46 
 
 		 180 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  47.62 
 
 		 345 aa  92.8  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  47.17 
 
 		 331 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  40.77 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  30.74 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  47.06 
 
 		 174 aa  89.4  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  54.65 
 
 		 349 aa  89.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  38.85 
 
 		 346 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  46.36 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  40.94 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  44.63 
 
 		 384 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  52.94 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  48.11 
 
 		 306 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  30.84 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  38.69 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.6 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  48.98 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  50 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  46.08 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.11 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.77 
 
 		 438 aa  82.4  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  52.33 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  43.33 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.32 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  50 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  53.16 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0223  YafL  37.59 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.73 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 501 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 452 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  38.21 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.677165 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  38.21 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  38.21 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  38.21 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  38.21 
 
 		 269 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5530  NLP/P60 protein  30.07 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.479781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  37.4 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  38.21 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  28.85 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  43.12 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  34.87 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  41.28 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  45.54 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  34.64 
 
 		 177 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  48.86 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  41.74 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.49 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.02 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  43.14 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  43.75 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  36.8 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  39.29 
 
 		 1048 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  45.92 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  41.12 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  37.59 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  36.5 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3653  NLP/P60 protein  31.34 
 
 		 232 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013969  normal  0.207873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  47.19 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.72 
 
 		 531 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  39.37 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>