More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2302 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 366 aa  704    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  57.65 
 
 		 429 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  51.94 
 
 		 378 aa  295  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  59.32 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  55.65 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  52.46 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  49.21 
 
 		 349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.5 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  51.09 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  57.02 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  46.81 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  45.74 
 
 		 906 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  58.82 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  48.11 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  51.16 
 
 		 844 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.1 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  40.24 
 
 		 381 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  46.38 
 
 		 302 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  44.26 
 
 		 355 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  37.82 
 
 		 443 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  37.82 
 
 		 443 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  36.69 
 
 		 434 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  37.82 
 
 		 443 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  38.32 
 
 		 662 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  52.04 
 
 		 352 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  38.3 
 
 		 453 aa  89.4  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  38.62 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  36.21 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  44.26 
 
 		 559 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  44.26 
 
 		 559 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  44.26 
 
 		 559 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  42.5 
 
 		 541 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  42.62 
 
 		 334 aa  86.7  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  42.62 
 
 		 331 aa  86.7  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  39.1 
 
 		 282 aa  86.3  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4376  lytic transglycosylase, catalytic  47.17 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  36.31 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  35.67 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  38.18 
 
 		 506 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  35.82 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  35.71 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2290  lytic transglycosylase, catalytic  41.73 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  30.27 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  37.5 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.88 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  33.54 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  35.43 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  54.05 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  34.36 
 
 		 252 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.11 
 
 		 251 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  44.76 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  37.93 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  37.34 
 
 		 815 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  40.27 
 
 		 546 aa  73.2  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  34.42 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  32.96 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  36.36 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  36.11 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  36.11 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  36.11 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  32.08 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  34.76 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  28.57 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  34.25 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  44.21 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  34.51 
 
 		 411 aa  67  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  52.48 
 
 		 362 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  34.76 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  40.45 
 
 		 682 aa  66.6  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  48.05 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  47.06 
 
 		 267 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  34.93 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  34.93 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0869  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.12 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.627939  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  43.75 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  43.75 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  41.49 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  41.56 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000590482  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  34.01 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  33.56 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 176 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3796  lytic murein transglycosylase B  53.57 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  34.69 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  47.62 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4092  lytic murein transglycosylase  47.3 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  41.43 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0977  murein hydrolase B  47.17 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3339  Zn-finger, DksA/TraR C4 type  53.7 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917071  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57730  murein hydrolase B  49.06 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3399  murein hydrolase B  47.17 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3179  murein hydrolase B  47.17 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2951  murein hydrolase B  47.17 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3017  murein hydrolase B  47.17 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  hitchhiker  0.00000130232 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2985  murein hydrolase B  45.45 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.26128  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2824  murein hydrolase B  45.45 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0997605  hitchhiker  0.00000822387 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3948  murein hydrolase B  45.45 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315849  normal  0.782651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>