More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2285 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  100 
 
 		 349 aa  712    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  56.84 
 
 		 423 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0869  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  50.68 
 
 		 416 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.627939  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  43.84 
 
 		 351 aa  236  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000590482  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0389  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  40.3 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  37.62 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  37.62 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1382  MltB  33.45 
 
 		 268 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.722344  normal  0.65352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2520  lytic murein transglycosylase B  35.03 
 
 		 347 aa  109  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160631  normal  0.119321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2099  lytic murein transglycosylase B  35.8 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3330  murein hydrolase B  28.16 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5017  murein hydrolase B  28.9 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3237  murein hydrolase B  32.31 
 
 		 383 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2383  lytic murein transglycosylase B  35.5 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2708  murein hydrolase B  29.14 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102119  hitchhiker  0.00940641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2160  lytic murein transglycosylase B  31.23 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2306  lytic murein transglycosylase B  36 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2817  lytic murein transglycosylase B  36 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510457  normal  0.280732 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1464  murein hydrolase B  28.81 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1351  murein hydrolase B  28.81 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.720495  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3399  murein hydrolase B  32.18 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0616  lytic murein transglycosylase B  29.55 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.573967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3017  murein hydrolase B  27.18 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  hitchhiker  0.00000130232 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3333  murein hydrolase B  31.61 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1242  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  31 
 
 		 366 aa  96.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00209703  normal  0.108974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0977  murein hydrolase B  31.61 
 
 		 361 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3033  murein hydrolase B  27.18 
 
 		 359 aa  95.9  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.986861  hitchhiker  0.00384978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2951  murein hydrolase B  26.86 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3796  lytic murein transglycosylase B  28.14 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0732  lytic murein transglycosylase B  35.76 
 
 		 408 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12080  soluble lytic transglycosylase B  29.53 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4823  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  29.06 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4363  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  28.92 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  34.01 
 
 		 271 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3140  murein hydrolase B  26.86 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57730  murein hydrolase B  31.61 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3149  lytic murein transglycosylase B  33.54 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0988  lytic murein transglycosylase B  31.12 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4805  lytic murein transglycosylase B  28.43 
 
 		 348 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785804  normal  0.425937 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1011  murein hydrolase B  31.12 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000289241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2556  lytic murein transglycosylase B  36.53 
 
 		 368 aa  93.2  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2837  murein hydrolase B  31.12 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359796  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2982  murein hydrolase B  26.54 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000956693 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2985  murein hydrolase B  31.12 
 
 		 361 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.26128  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3176  murein hydrolase B  31.12 
 
 		 361 aa  92.8  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417908  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4680  lytic murein transglycosylase B  28.43 
 
 		 336 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02551  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  31.12 
 
 		 361 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02516  hypothetical protein  31.12 
 
 		 361 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.360268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2824  murein hydrolase B  31.12 
 
 		 361 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0997605  hitchhiker  0.00000822387 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3948  murein hydrolase B  31.12 
 
 		 361 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315849  normal  0.782651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4858  lytic murein transglycosylase B  28.29 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2077  lytic murein transglycosylase B  33.33 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0554951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08410  lytic murein transglycosylase B  29.65 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.562186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2846  lytic murein transglycosylase B  27.7 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000891968  hitchhiker  0.000000969149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0918  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  34.76 
 
 		 372 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.841841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3380  lytic murein transglycosylase B  35.54 
 
 		 363 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0518683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4968  lytic murein transglycosylase B  29.53 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2545  lytic murein transglycosylase B  32.54 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1108  soluble lytic transglycosylase B  29.02 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0859  lytic murein transglycosylase B  34.15 
 
 		 374 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2114  murein hydrolase B  28.5 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1216  lytic murein transglycosylase B  31.33 
 
 		 363 aa  89.7  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  28.81 
 
 		 438 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0788  lytic murein transglycosylase B  34.15 
 
 		 374 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.297958 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  27.48 
 
 		 417 aa  89.7  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1158  hypothetical protein  29.9 
 
 		 273 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441792  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  28.76 
 
 		 438 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  28.76 
 
 		 438 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6768  hypothetical protein  31.16 
 
 		 272 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0634342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1547  lytic murein transglycosylase B  30.64 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0755  lytic murein transglycosylase B  27.18 
 
 		 462 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  32.95 
 
 		 404 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2248  lytic murein transglycosylase B  33.74 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1056  lytic murein transglycosylase B  30.1 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0577  lytic murein transglycosylase B  28.89 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1315  lytic murein transglycosylase B  26.67 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.213474  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0417  murein transglycosylase domain-containing protein  30.81 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  30.81 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2561  murein transglycosylase domain-containing protein  30.81 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2983  murein transglycosylase domain-containing protein  30.81 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1972  lytic murein transglycosylase B  29.26 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0937  murein transglycosylase domain-containing protein  30.81 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2873  lytic murein transglycosylase B  30.81 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0861868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2936  lytic murein transglycosylase B  30.81 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1385  membrane-bound lytic transglycosylase  26.33 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0841166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1558  lytic murein transglycosylase B  28.8 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000667171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0212  murein transglycosylase domain-containing protein  30.81 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4169  lytic murein transglycosylase B  28.89 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.743519  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  28.94 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  27.49 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2992  lytic murein transglycosylase B  30 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106271  hitchhiker  0.00132596 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1647  murein transglycosylase domain-containing protein  30.61 
 
 		 456 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1015  lytic murein transglycosylase B  28.44 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0991  putative murein transglycosylase  29.5 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3012  lytic murein transglycosylase B  32.95 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0932  lytic murein transglycosylase B  29.78 
 
 		 448 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0936  lytic murein transglycosylase B  29.78 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0724  lytic murein transglycosylase B  32.26 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3183  lytic murein transglycosylase  31.45 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  26.21 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>