More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0869 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0869  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  100 
 
 		 416 aa  852    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.627939  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  51.96 
 
 		 423 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  50.68 
 
 		 349 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  45.88 
 
 		 351 aa  236  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000590482  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0389  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  36.95 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  31.01 
 
 		 336 aa  133  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  31.01 
 
 		 336 aa  133  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1382  MltB  32.72 
 
 		 268 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.722344  normal  0.65352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4363  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  29.08 
 
 		 335 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4968  lytic murein transglycosylase B  32.97 
 
 		 336 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1547  lytic murein transglycosylase B  32.32 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08410  lytic murein transglycosylase B  29.92 
 
 		 342 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.562186  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3330  murein hydrolase B  29.44 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1469  peptidoglycan N-acetylmuramoylhydrolase  29.01 
 
 		 331 aa  87.8  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143002  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2590  lytic murein transglycosylase B  28.94 
 
 		 329 aa  87  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164218  normal  0.320646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  30.29 
 
 		 457 aa  87  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0977  murein hydrolase B  29.54 
 
 		 361 aa  86.7  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  30 
 
 		 422 aa  86.3  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3333  murein hydrolase B  29.69 
 
 		 356 aa  86.7  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  31.22 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3237  murein hydrolase B  27.53 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4823  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  29.08 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3277  lytic murein transglycosylase B  31.09 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000759763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1558  lytic murein transglycosylase B  31.16 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000667171  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3319  lytic murein transglycosylase B  31.09 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000245768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1090  lytic murein transglycosylase B  31.09 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257265  hitchhiker  0.00000204091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4805  lytic murein transglycosylase B  31.87 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785804  normal  0.425937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5017  murein hydrolase B  29.44 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3017  murein hydrolase B  27.8 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  hitchhiker  0.00000130232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4858  lytic murein transglycosylase B  31.87 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3033  murein hydrolase B  27.8 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.986861  hitchhiker  0.00384978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3796  lytic murein transglycosylase B  32.78 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2951  murein hydrolase B  27.8 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12080  soluble lytic transglycosylase B  32 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3399  murein hydrolase B  30.39 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3455  lytic murein transglycosylase B  31.09 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000138517  normal  0.0101722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0616  lytic murein transglycosylase B  31.69 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.573967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4680  lytic murein transglycosylase B  31.87 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57730  murein hydrolase B  28.89 
 
 		 367 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1108  soluble lytic transglycosylase B  32 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  30.14 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  26.47 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  30.14 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2114  murein hydrolase B  30.49 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  27.57 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04282  lytic murein transglycosylase B  31.98 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  30.81 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  27.57 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0988  lytic murein transglycosylase B  28.12 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  30.27 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1011  murein hydrolase B  28.12 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000289241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  28.77 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  30.27 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2982  murein hydrolase B  27.32 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000956693 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2837  murein hydrolase B  28.12 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359796  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02551  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  28.12 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2846  lytic murein transglycosylase B  26.32 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000891968  hitchhiker  0.000000969149 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  24.65 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02516  hypothetical protein  28.12 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.360268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3948  murein hydrolase B  28.12 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315849  normal  0.782651 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2824  murein hydrolase B  28.12 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0997605  hitchhiker  0.00000822387 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3176  murein hydrolase B  28.12 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417908  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3448  lytic murein transglycosylase B  31.98 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2985  murein hydrolase B  28.12 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.26128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1464  murein hydrolase B  27.6 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1351  murein hydrolase B  27.6 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.720495  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2871  lytic murein transglycosylase B  30.57 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000283207  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3140  murein hydrolase B  27.32 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011218 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2708  murein hydrolase B  27.6 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102119  hitchhiker  0.00940641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1166  membrane-bound lytic transglycosylase, putative  30.57 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2383  lytic murein transglycosylase B  27.54 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  29.69 
 
 		 400 aa  79.7  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2438  lytic murein transglycosylase  25.76 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0613542 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0853  lytic murein transglycosylase B  28.5 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  28.14 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0993  lytic murein transglycosylase B  30.05 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000510709  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  28.1 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1242  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  26.03 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00209703  normal  0.108974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3151  lytic murein transglycosylase B  29.53 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000109427  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0989  lytic murein transglycosylase B  30.05 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000275469  normal  0.0108965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1054  lytic murein transglycosylase B  30.05 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000218585  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2306  lytic murein transglycosylase B  26.57 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2817  lytic murein transglycosylase B  26.57 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510457  normal  0.280732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3012  lytic murein transglycosylase B  27.43 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  28.8 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  28.08 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3183  lytic murein transglycosylase  25.57 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2099  lytic murein transglycosylase B  28.86 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  27.27 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1828  lytic murein transglycosylase, putative  23.91 
 
 		 275 aa  75.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  25.96 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  27.94 
 
 		 430 aa  76.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1759  putative lytic murein transglycosylase  23.91 
 
 		 275 aa  75.9  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.89395  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  27.92 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1294  lytic murein transglycosylase B  26.53 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378747 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1385  membrane-bound lytic transglycosylase  30.2 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0841166  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  28.92 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1315  lytic murein transglycosylase B  32.57 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.213474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0697  lytic murein transglycosylase B  25.69 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0681454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  29.69 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>