More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1469 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1469  peptidoglycan N-acetylmuramoylhydrolase  100 
 
 		 331 aa  679    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.143002  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0616  lytic murein transglycosylase B  36.91 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.573967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4805  lytic murein transglycosylase B  36.45 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785804  normal  0.425937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4680  lytic murein transglycosylase B  36.65 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4858  lytic murein transglycosylase B  36.45 
 
 		 336 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3796  lytic murein transglycosylase B  37.02 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1838  hypothetical protein  37.81 
 
 		 338 aa  176  7e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0174  lytic murein transglycosylase B  35.71 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.35243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12080  soluble lytic transglycosylase B  36.48 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1835  hypothetical protein  37.72 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4968  lytic murein transglycosylase B  37.93 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4363  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  36.18 
 
 		 335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1108  soluble lytic transglycosylase B  36.25 
 
 		 336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3339  Zn-finger, DksA/TraR C4 type  32.62 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917071  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4823  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  36.45 
 
 		 335 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08410  lytic murein transglycosylase B  35.01 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.562186  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2709  lytic murein transglycosylase B  38.08 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31024  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  34.12 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1010  lytic murein transglycosylase B  37.81 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  35.76 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  36.81 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2846  lytic murein transglycosylase B  34.24 
 
 		 351 aa  166  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000891968  hitchhiker  0.000000969149 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  34.15 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  33.64 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0724  lytic murein transglycosylase B  36.94 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  35.49 
 
 		 424 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1972  lytic murein transglycosylase B  35.71 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  35.49 
 
 		 430 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  35.99 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  35.49 
 
 		 424 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2937  lytic murein transglycosylase B  33.77 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000220956  normal  0.0240906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.18 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1090  lytic murein transglycosylase B  35.04 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257265  hitchhiker  0.00000204091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3277  lytic murein transglycosylase B  35.4 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000759763  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1019  putative lytic murein transglycosylase  39.02 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2590  lytic murein transglycosylase B  35.34 
 
 		 329 aa  160  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164218  normal  0.320646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2520  lytic murein transglycosylase B  39.75 
 
 		 347 aa  160  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160631  normal  0.119321 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3319  lytic murein transglycosylase B  35.04 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000245768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1149  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  38.64 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  33.64 
 
 		 362 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1464  murein hydrolase B  33.33 
 
 		 364 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1351  murein hydrolase B  33.12 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.720495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3012  lytic murein transglycosylase B  34.58 
 
 		 354 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  36.33 
 
 		 438 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  33.44 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  33.64 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3455  lytic murein transglycosylase B  35.04 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000138517  normal  0.0101722 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  33.53 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  36.33 
 
 		 438 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  36.33 
 
 		 411 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  35.15 
 
 		 415 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1269  lytic murein transglycosylase B  35.56 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.282145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  36.21 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  37.37 
 
 		 448 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  35.99 
 
 		 436 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  35.84 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0989  lytic murein transglycosylase B  35.98 
 
 		 354 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000275469  normal  0.0108965 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2708  murein hydrolase B  32.81 
 
 		 364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102119  hitchhiker  0.00940641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5017  murein hydrolase B  35.36 
 
 		 371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57730  murein hydrolase B  35.07 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  34.26 
 
 		 331 aa  156  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2114  murein hydrolase B  32.73 
 
 		 373 aa  155  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1054  lytic murein transglycosylase B  35.23 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000218585  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0697  lytic murein transglycosylase B  31.01 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0681454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2099  lytic murein transglycosylase B  35.76 
 
 		 365 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3399  murein hydrolase B  31.97 
 
 		 361 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  36.52 
 
 		 346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  36.04 
 
 		 432 aa  152  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3149  lytic murein transglycosylase B  33.63 
 
 		 366 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1242  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  33.33 
 
 		 366 aa  152  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00209703  normal  0.108974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0993  lytic murein transglycosylase B  35.23 
 
 		 354 aa  152  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000510709  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  36.14 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3710  lytic murein transglycosylase B  36.47 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000626578  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2160  lytic murein transglycosylase B  34.68 
 
 		 361 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  35.47 
 
 		 448 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  34.71 
 
 		 434 aa  149  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1166  membrane-bound lytic transglycosylase, putative  33.09 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  35.86 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2634  lytic murein transglycosylase B  32.87 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2517  lytic murein transglycosylase  35.29 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000972564  normal  0.926391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3487  lytic murein transglycosylase B  36.47 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153409  hitchhiker  0.0000000197037 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0977  murein hydrolase B  34.14 
 
 		 361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  36.84 
 
 		 438 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  35.79 
 
 		 424 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  36.76 
 
 		 427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1558  lytic murein transglycosylase B  35.13 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000667171  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  37.97 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  37.97 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  36.3 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  30.94 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2871  lytic murein transglycosylase B  33.21 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000283207  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  31.21 
 
 		 347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  33.54 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0853  lytic murein transglycosylase B  33.83 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114292  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1547  lytic murein transglycosylase B  34.06 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  35.34 
 
 		 409 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3448  lytic murein transglycosylase B  34.71 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  36.9 
 
 		 417 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  36.9 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>