More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2801 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 331 aa  686    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01141  putative transglycosylase  61.04 
 
 		 323 aa  427  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.629651  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  56.67 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  53.92 
 
 		 347 aa  355  3.9999999999999996e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  52.34 
 
 		 323 aa  347  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  52.34 
 
 		 323 aa  347  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  51.86 
 
 		 323 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  54.15 
 
 		 324 aa  339  4e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2754  lytic murein transglycosylase  49.67 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000102797  hitchhiker  0.000133589 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  47.97 
 
 		 362 aa  299  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  47.97 
 
 		 361 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  47.64 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2517  lytic murein transglycosylase  46.42 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000972564  normal  0.926391 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  41.49 
 
 		 409 aa  280  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2442  lytic murein transglycosylase  45.54 
 
 		 331 aa  276  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00214249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1904  lytic murein transglycosylase  44.1 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.025136  normal  0.972057 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2422  lytic murein transglycosylase  43.79 
 
 		 370 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000759063  hitchhiker  0.00536739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1870  lytic murein transglycosylase  43.48 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000324668  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1897  lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 		 370 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000349949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  41.12 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  39.8 
 
 		 428 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  40.98 
 
 		 454 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  43.91 
 
 		 448 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1149  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.67 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1019  putative lytic murein transglycosylase  40.67 
 
 		 333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  40.54 
 
 		 400 aa  252  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  39.53 
 
 		 395 aa  248  8e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  42.47 
 
 		 445 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  40.73 
 
 		 438 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  43.19 
 
 		 448 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  40.13 
 
 		 377 aa  246  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  42.47 
 
 		 445 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2846  hypothetical protein  37.42 
 
 		 320 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2988  hypothetical protein  37.11 
 
 		 320 aa  246  6e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2380  putative transglycosylase  41.74 
 
 		 333 aa  245  9e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00018447  normal  0.231561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  38.41 
 
 		 430 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  38.36 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2171  putative transglycosylase  42.06 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000761177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2248  putative transglycosylase  43.65 
 
 		 333 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00479266  normal  0.458492 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  38.36 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  38.36 
 
 		 411 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  38.36 
 
 		 436 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.11 
 
 		 421 aa  243  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  37.12 
 
 		 396 aa  242  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2116  lytic murein transglycosylase  40.59 
 
 		 329 aa  242  7e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286626  normal  0.0851142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  38.21 
 
 		 424 aa  242  7e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  38.54 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  38.21 
 
 		 424 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  38.21 
 
 		 433 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  41.47 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  40.79 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  39.46 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  40.66 
 
 		 470 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  39.39 
 
 		 440 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  38.46 
 
 		 395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  38.24 
 
 		 421 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  40.4 
 
 		 415 aa  235  9e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2437  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.46 
 
 		 363 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  36.78 
 
 		 415 aa  233  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  36.75 
 
 		 427 aa  232  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  40.13 
 
 		 432 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  38.34 
 
 		 409 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  39.47 
 
 		 455 aa  228  7e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  39.73 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  40.4 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  38.03 
 
 		 424 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  37.83 
 
 		 419 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  36.45 
 
 		 417 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  39.53 
 
 		 474 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  37.5 
 
 		 417 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  39.39 
 
 		 438 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  39.39 
 
 		 438 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  34.98 
 
 		 437 aa  224  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  39.39 
 
 		 438 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  39.34 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  37.62 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  38.87 
 
 		 466 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  38 
 
 		 401 aa  220  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  38.93 
 
 		 411 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  35.54 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  38.33 
 
 		 462 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  38.46 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  37.46 
 
 		 425 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  38 
 
 		 413 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1928  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.8 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  36.45 
 
 		 434 aa  212  7.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  35.31 
 
 		 422 aa  209  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0024  lytic murein transglycosylase  36.39 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal  0.0161595 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  34.98 
 
 		 406 aa  205  9e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  34.43 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1739  membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.62 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  36.48 
 
 		 514 aa  203  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  38.54 
 
 		 390 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  35.02 
 
 		 398 aa  202  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  34.1 
 
 		 398 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  34.07 
 
 		 464 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  35.17 
 
 		 398 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  35.43 
 
 		 404 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  36.84 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  37.54 
 
 		 391 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>