More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_12160 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  90.71 
 
 		 448 aa  816    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  100 
 
 		 448 aa  904    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  62.39 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  63.34 
 
 		 440 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  61.61 
 
 		 445 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  69.35 
 
 		 438 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  66.07 
 
 		 438 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  63.26 
 
 		 438 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  62.09 
 
 		 438 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  62.33 
 
 		 438 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  61.9 
 
 		 418 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  56.82 
 
 		 427 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  51.67 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  54.28 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  53.87 
 
 		 438 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  46.56 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  53.89 
 
 		 470 aa  382  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  52.85 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  50.64 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  50 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  53.35 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  51.88 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  49.76 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  50.12 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  53.23 
 
 		 409 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  50.81 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  51.05 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  53.49 
 
 		 390 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  49.03 
 
 		 415 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  49.87 
 
 		 455 aa  362  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  50.14 
 
 		 398 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  49.06 
 
 		 398 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  49.6 
 
 		 454 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  49.46 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  45.22 
 
 		 422 aa  341  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  48.84 
 
 		 413 aa  341  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  48.45 
 
 		 418 aa  338  8e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  46.11 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  48.21 
 
 		 413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  49.6 
 
 		 429 aa  335  7.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  47.77 
 
 		 514 aa  333  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  48.27 
 
 		 720 aa  331  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  50.13 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  46.22 
 
 		 398 aa  329  7e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  44.62 
 
 		 409 aa  329  8e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  47.51 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  46.48 
 
 		 398 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  45.6 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  48.16 
 
 		 462 aa  326  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  47.89 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  43.73 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  47.21 
 
 		 412 aa  323  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  45.82 
 
 		 429 aa  323  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  45.65 
 
 		 461 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  46.47 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  44.72 
 
 		 464 aa  320  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  48.73 
 
 		 400 aa  319  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  45.09 
 
 		 425 aa  318  9e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  47.62 
 
 		 411 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  46.68 
 
 		 408 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  45.21 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  45.03 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  45.24 
 
 		 412 aa  313  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  44.57 
 
 		 470 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  44.82 
 
 		 407 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  48.39 
 
 		 392 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  45.6 
 
 		 406 aa  312  6.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  45.11 
 
 		 469 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  43.21 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  44.82 
 
 		 407 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  44.02 
 
 		 481 aa  309  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  45.48 
 
 		 405 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  44.62 
 
 		 400 aa  309  8e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  50.54 
 
 		 391 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  44.33 
 
 		 410 aa  305  9.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  47.17 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  47.17 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  46.84 
 
 		 400 aa  302  9e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  43.3 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  44.65 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  45.1 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  42.78 
 
 		 490 aa  296  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  43.5 
 
 		 418 aa  295  8e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  43.2 
 
 		 419 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  42.97 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  43.82 
 
 		 395 aa  292  8e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  41.6 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  46.41 
 
 		 486 aa  291  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  43.68 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 		 445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  42.4 
 
 		 474 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  43.77 
 
 		 407 aa  282  9e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  39.79 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  40.7 
 
 		 421 aa  282  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  43.65 
 
 		 416 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  42.78 
 
 		 412 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  41.08 
 
 		 396 aa  278  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  43.7 
 
 		 415 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  40.26 
 
 		 428 aa  277  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  42.51 
 
 		 434 aa  277  4e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>