More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3432 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 428 aa  885    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  56.54 
 
 		 421 aa  482  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  54.62 
 
 		 396 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  52.93 
 
 		 411 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  52.13 
 
 		 438 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  51.08 
 
 		 424 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  51.08 
 
 		 430 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  55.86 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  55.59 
 
 		 438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  55.04 
 
 		 439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  50.84 
 
 		 424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  52.07 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  56.13 
 
 		 395 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  52.42 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  55.04 
 
 		 395 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  54.77 
 
 		 377 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  52.04 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  53.89 
 
 		 401 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  47.78 
 
 		 410 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  46.76 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  47.96 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  45.78 
 
 		 427 aa  361  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  46.96 
 
 		 409 aa  354  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  45.9 
 
 		 454 aa  323  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  43.13 
 
 		 470 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  42.15 
 
 		 457 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  42.01 
 
 		 434 aa  300  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  40.66 
 
 		 434 aa  295  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  40.69 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  40.11 
 
 		 417 aa  292  9e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  39.79 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  40.67 
 
 		 430 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  39.85 
 
 		 422 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  40.11 
 
 		 419 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  38.7 
 
 		 421 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  41.6 
 
 		 413 aa  286  7e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  40.8 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  41.32 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  38.03 
 
 		 445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  39.95 
 
 		 466 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  40.64 
 
 		 398 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  37.18 
 
 		 445 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  40.38 
 
 		 474 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  39.78 
 
 		 409 aa  282  7.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  39.95 
 
 		 432 aa  282  9e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  38.89 
 
 		 440 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  37.82 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  40.26 
 
 		 448 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  40.05 
 
 		 404 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  38.28 
 
 		 427 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  41.14 
 
 		 429 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  39.68 
 
 		 438 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  39.68 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  39.68 
 
 		 438 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  39.68 
 
 		 438 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  39.18 
 
 		 438 aa  273  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  38.36 
 
 		 415 aa  272  8.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  40.59 
 
 		 398 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  41.59 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  38.48 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  38.27 
 
 		 443 aa  270  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  38.75 
 
 		 398 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  38.98 
 
 		 398 aa  269  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  41.88 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  38.63 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  39.31 
 
 		 448 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  37.33 
 
 		 412 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  38.99 
 
 		 720 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  39.84 
 
 		 417 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  41.67 
 
 		 418 aa  266  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  39.46 
 
 		 411 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  39.45 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  40.52 
 
 		 323 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  41.18 
 
 		 429 aa  262  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  38.26 
 
 		 462 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  38.26 
 
 		 458 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  39.52 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  40.07 
 
 		 324 aa  260  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  38.31 
 
 		 400 aa  259  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2801  lytic murein transglycosylase  39.8 
 
 		 331 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  38.76 
 
 		 430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  36.68 
 
 		 461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  34.53 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  36.14 
 
 		 424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  37.84 
 
 		 491 aa  253  6e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  36.39 
 
 		 470 aa  253  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  37.03 
 
 		 462 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  37.03 
 
 		 413 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  35.7 
 
 		 481 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  35.66 
 
 		 425 aa  252  9.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  37.13 
 
 		 434 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  36.96 
 
 		 451 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  36.56 
 
 		 396 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  37.23 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  36.24 
 
 		 464 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  37.76 
 
 		 349 aa  250  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  37.06 
 
 		 394 aa  250  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  38.59 
 
 		 323 aa  250  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  38.26 
 
 		 323 aa  249  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  39.34 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>