More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2957 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  100 
 
 
470 aa  952    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  78.62 
 
 
461 aa  697    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  74.73 
 
 
464 aa  724    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  73.78 
 
 
464 aa  690    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  75.48 
 
 
451 aa  721    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  76.44 
 
 
469 aa  690    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  86.44 
 
 
481 aa  809    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  57.73 
 
 
443 aa  477  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  47.45 
 
 
398 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  46.92 
 
 
398 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  45.62 
 
 
445 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  45.36 
 
 
445 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  46.82 
 
 
429 aa  345  8e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  49.16 
 
 
400 aa  343  5e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  46.95 
 
 
398 aa  336  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  46.67 
 
 
404 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  43.62 
 
 
427 aa  334  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  47.86 
 
 
422 aa  332  8e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  45.6 
 
 
398 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  47.06 
 
 
720 aa  326  5e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  45.87 
 
 
398 aa  325  9e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  45.77 
 
 
413 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  45.99 
 
 
418 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  45.1 
 
 
413 aa  323  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  44.53 
 
 
398 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  45.48 
 
 
398 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  45.68 
 
 
438 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  45.33 
 
 
418 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  42.06 
 
 
438 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 
440 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  44.57 
 
 
448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  41.8 
 
 
438 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  46.7 
 
 
423 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  41.8 
 
 
438 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  41.53 
 
 
438 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  43.41 
 
 
448 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  43.65 
 
 
421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  43.75 
 
 
419 aa  302  7.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  46.97 
 
 
417 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  46.97 
 
 
419 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  43.38 
 
 
405 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  43.98 
 
 
430 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  47.04 
 
 
409 aa  297  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  47.48 
 
 
438 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  42.57 
 
 
455 aa  293  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  44.12 
 
 
486 aa  292  9e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  43.88 
 
 
415 aa  291  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  43.39 
 
 
430 aa  290  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  45.54 
 
 
432 aa  287  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  44.11 
 
 
424 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  41.03 
 
 
410 aa  286  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  42.15 
 
 
405 aa  285  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  42.15 
 
 
407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  42.37 
 
 
514 aa  283  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  44.48 
 
 
466 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  40.68 
 
 
412 aa  280  4e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  40.59 
 
 
417 aa  279  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  42.47 
 
 
392 aa  279  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  40.33 
 
 
474 aa  279  9e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  41.78 
 
 
470 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  41.33 
 
 
413 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  42.82 
 
 
390 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  44.18 
 
 
474 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  39.9 
 
 
407 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  36 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  38.14 
 
 
395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  40.32 
 
 
405 aa  274  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  38.98 
 
 
377 aa  273  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  39.49 
 
 
412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  38.85 
 
 
491 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  38.76 
 
 
434 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  40.16 
 
 
408 aa  272  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  41.55 
 
 
393 aa  272  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  38.58 
 
 
490 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  41.55 
 
 
393 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.6 
 
 
421 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  42.74 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  36.61 
 
 
411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  37.57 
 
 
438 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  40.86 
 
 
400 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  36.93 
 
 
435 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  43.45 
 
 
457 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  37.57 
 
 
438 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  37.57 
 
 
436 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  39.63 
 
 
454 aa  263  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  41.27 
 
 
429 aa  263  6.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  36.87 
 
 
439 aa  262  8e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  37.6 
 
 
430 aa  262  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  39.45 
 
 
407 aa  262  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  37.91 
 
 
395 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  36.5 
 
 
424 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.33 
 
 
433 aa  260  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.33 
 
 
462 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  36.25 
 
 
424 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  40.33 
 
 
413 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  36.53 
 
 
395 aa  259  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  42.15 
 
 
416 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  35.97 
 
 
396 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  38.71 
 
 
400 aa  257  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  37.53 
 
 
415 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>