More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3790 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 418 aa  834    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  67.21 
 
 		 438 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  58.37 
 
 		 445 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  58.14 
 
 		 445 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  57.31 
 
 		 440 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  57.67 
 
 		 448 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  58.21 
 
 		 427 aa  475  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  57.41 
 
 		 438 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  57.48 
 
 		 448 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  57.88 
 
 		 438 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  60.05 
 
 		 438 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  57.41 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  50.97 
 
 		 432 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  49.14 
 
 		 413 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  48.52 
 
 		 415 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  47.77 
 
 		 417 aa  363  4e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  49.27 
 
 		 409 aa  360  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  45.71 
 
 		 435 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  49.74 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  48.02 
 
 		 454 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  50.54 
 
 		 438 aa  355  8.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  49.62 
 
 		 417 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  47.69 
 
 		 434 aa  353  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  48.84 
 
 		 421 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  50.4 
 
 		 419 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  47.78 
 
 		 457 aa  349  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  52.01 
 
 		 390 aa  346  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  45.99 
 
 		 422 aa  346  5e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  45.08 
 
 		 455 aa  345  7e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  46.28 
 
 		 424 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  48.08 
 
 		 413 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  47.07 
 
 		 720 aa  338  9e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  47.42 
 
 		 466 aa  336  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  48.54 
 
 		 413 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  45.43 
 
 		 461 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  45.97 
 
 		 464 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  47.48 
 
 		 418 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  47.79 
 
 		 474 aa  334  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  47.86 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  45.97 
 
 		 470 aa  333  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  44.04 
 
 		 470 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  47.43 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  46.86 
 
 		 464 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  47.83 
 
 		 400 aa  328  8e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  45.1 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  48 
 
 		 481 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  43.9 
 
 		 410 aa  324  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  43.9 
 
 		 398 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  43.88 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  42.52 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  45.5 
 
 		 398 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  46.81 
 
 		 462 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  45.5 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  40.67 
 
 		 409 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  46.81 
 
 		 413 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  45.04 
 
 		 398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  49 
 
 		 400 aa  319  6e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  43.85 
 
 		 451 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  48.13 
 
 		 411 aa  319  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  45.3 
 
 		 398 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  45.41 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  48.95 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  47.59 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  44.15 
 
 		 430 aa  315  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  46.88 
 
 		 392 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  47.61 
 
 		 393 aa  310  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  47.34 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  46.36 
 
 		 514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  44.09 
 
 		 406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  42.93 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  45.92 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  43.5 
 
 		 412 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  43.35 
 
 		 405 aa  300  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  42.46 
 
 		 395 aa  299  8e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  40.28 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  43.5 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  43.12 
 
 		 412 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  42.4 
 
 		 407 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.43 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  41.98 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  43.78 
 
 		 419 aa  293  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  42.97 
 
 		 408 aa  293  5e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  46.76 
 
 		 391 aa  292  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  42.93 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  39.68 
 
 		 421 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  41.78 
 
 		 377 aa  289  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  40.76 
 
 		 417 aa  289  6e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  40.35 
 
 		 415 aa  286  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  41.55 
 
 		 396 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  43.4 
 
 		 407 aa  285  8e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  41.03 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  40.83 
 
 		 491 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0039  lytic murein transglycosylase  46.55 
 
 		 396 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  40.68 
 
 		 490 aa  282  9e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  38.83 
 
 		 430 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  38.65 
 
 		 424 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  38.59 
 
 		 424 aa  279  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  41.15 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  38.61 
 
 		 445 aa  277  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  37.91 
 
 		 438 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>